15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1286 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1286  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2114  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  29.32 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  28.06 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  48 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  25.9 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  25.9 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  47.92 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  27.27 
 
 		 201 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  27.08 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  33.08 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  27.46 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  32.09 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  27.21 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>