More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1048 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  87.76 
 
 		 392 aa  678    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  88.52 
 
 		 392 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  786    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  72.47 
 
 		 391 aa  561  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  68.88 
 
 		 395 aa  535  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  65.88 
 
 		 391 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  67.52 
 
 		 393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  41.22 
 
 		 389 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  40.57 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  39.09 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  41.01 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  42.26 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  40.4 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  38.83 
 
 		 389 aa  245  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  41.62 
 
 		 387 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  40.77 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  37.88 
 
 		 387 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  37.34 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  40.46 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  36.07 
 
 		 451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  32.79 
 
 		 401 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  34.69 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  29.72 
 
 		 391 aa  152  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  30.39 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  34.44 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  34.79 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  29.72 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  33.42 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  29.63 
 
 		 398 aa  144  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  26.97 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  30.73 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  29.49 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  27.55 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  31.04 
 
 		 391 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  29.18 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0133  putative aminotransferase  31.64 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  29.49 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  31.93 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  31.16 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0118  putative aminotransferase  32.12 
 
 		 384 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 		 404 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2936  putative aminotransferase  31.65 
 
 		 384 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  31.65 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  31.27 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  30.66 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.11 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  30.48 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  30.16 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  29.14 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  31.25 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  30.25 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  30.75 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  28.87 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  29.62 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  31.68 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.21 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  28.95 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  29.68 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  28.65 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  31.11 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  26.88 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  31.2 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  25.8 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  31.55 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  30.47 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  31.32 
 
 		 384 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  32.11 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  29.95 
 
 		 386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  35.02 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  29.69 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  31.61 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  31.64 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  26.15 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  33.43 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  30.22 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  29.6 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  31.33 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  29.51 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  31.46 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  27.49 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  32.94 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  32.04 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2600  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.492563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  28.61 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0157  putative aminotransferase  29.75 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  26.81 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3953  putative aminotransferase  29.75 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  29.31 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  31.87 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4026  putative aminotransferase  29.75 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  32.65 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  29.14 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  30.62 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  25.36 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  28.26 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1570  putative aminotransferase  29.23 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>