47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0939 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0939  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.702425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  92.73 
 
 		 1033 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  58.69 
 
 		 1039 aa  252  7e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  50 
 
 		 1039 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  38.94 
 
 		 1081 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  37.13 
 
 		 1087 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  38.31 
 
 		 1112 aa  132  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  41.06 
 
 		 1102 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  41.11 
 
 		 1035 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  35.32 
 
 		 905 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1059 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  34.01 
 
 		 1052 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1063 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1069 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  32.46 
 
 		 1067 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1060 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  32.46 
 
 		 1051 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1041 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  30.39 
 
 		 1085 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  29.9 
 
 		 1079 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  29.94 
 
 		 1000 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  27.08 
 
 		 1035 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  27.83 
 
 		 997 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  27.57 
 
 		 1027 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  32.48 
 
 		 1073 aa  60.1  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  24.34 
 
 		 1078 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  28.32 
 
 		 965 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  30.68 
 
 		 1029 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  29.7 
 
 		 1009 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  31.76 
 
 		 990 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3543  type I restriction-modification system restriction subunit  27.16 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  25.19 
 
 		 984 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1007 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  26.76 
 
 		 992 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  27.5 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1022 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  27.01 
 
 		 1002 aa  53.1  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  25.74 
 
 		 999 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1008 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  23.86 
 
 		 983 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1031 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  24.02 
 
 		 1023 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  28.23 
 
 		 989 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  25.82 
 
 		 1142 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  24.38 
 
 		 1009 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  26.2 
 
 		 969 aa  43.1  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  22.78 
 
 		 1012 aa  42.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>