More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0931 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  86.73 
 
 		 294 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  86.39 
 
 		 294 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  51.26 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  47.35 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  50.35 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  45.16 
 
 		 297 aa  231  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.52 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  44.17 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  44.17 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  44.17 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  43.64 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  45.02 
 
 		 285 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.21 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  47.46 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.49 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  42.51 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  41.34 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  37.98 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  36.77 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  36.45 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  36.45 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  39.07 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  36.55 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  36.68 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.97 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  40.5 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  31.99 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  34 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35 
 
 		 314 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.32 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  35.17 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  33 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  30.69 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  33.11 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  35.74 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.3 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1038  hypothetical protein  33.79 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  29.79 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  32.89 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  37.82 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  34.65 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  32.57 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 305 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  35.32 
 
 		 320 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  35.13 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  34.12 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  32.99 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  34.51 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  31.82 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  32.32 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  34.51 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  35.75 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  35.75 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  29.12 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  33.93 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  34.8 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32.76 
 
 		 331 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  35.35 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  34.01 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.4 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  30.82 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  34.86 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  31.47 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  29.62 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  30.88 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  32.74 
 
 		 289 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  30.3 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  30.3 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  31.06 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.42 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  32.28 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  30.85 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  30.85 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.18 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  29.47 
 
 		 306 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  29.23 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  35.05 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  31.82 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  31.82 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  31.46 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.42 
 
 		 312 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  31.72 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  30.36 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.57 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 322 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.99 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  34.78 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  29.97 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  32.57 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  32.85 
 
 		 281 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>