73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0911 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  81.12 
 
 		 207 aa  328  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  80.51 
 
 		 207 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  53.05 
 
 		 220 aa  224  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  55.91 
 
 		 833 aa  218  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  44.16 
 
 		 1462 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  43.96 
 
 		 369 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  47.7 
 
 		 561 aa  148  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  46.86 
 
 		 364 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  39.73 
 
 		 353 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  37.17 
 
 		 387 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  47.75 
 
 		 356 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  47.03 
 
 		 354 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  39.77 
 
 		 792 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  40.7 
 
 		 589 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  38.38 
 
 		 1043 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  41.21 
 
 		 425 aa  131  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  40.2 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  36.97 
 
 		 477 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  37.93 
 
 		 530 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  38.25 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  41.07 
 
 		 351 aa  118  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  40.94 
 
 		 950 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  42.44 
 
 		 398 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  39.01 
 
 		 767 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  37.78 
 
 		 854 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  36.36 
 
 		 526 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  36.13 
 
 		 743 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  37.5 
 
 		 342 aa  99  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  38.27 
 
 		 447 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  41.5 
 
 		 465 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  40.94 
 
 		 465 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  38.36 
 
 		 418 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  33.53 
 
 		 340 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  35.03 
 
 		 452 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  39.73 
 
 		 352 aa  91.7  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  36.5 
 
 		 363 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  39.31 
 
 		 343 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  36.81 
 
 		 346 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  35.38 
 
 		 342 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  35.17 
 
 		 1050 aa  89.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  40 
 
 		 848 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  40.56 
 
 		 346 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  39.04 
 
 		 594 aa  89  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  38.71 
 
 		 516 aa  88.6  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  36.99 
 
 		 460 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  38.93 
 
 		 308 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  33.55 
 
 		 499 aa  85.5  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  32.53 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  33.75 
 
 		 469 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  35.04 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  33.73 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  33.73 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  31.9 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  32.73 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  33.75 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  36.99 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  30.07 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  32.88 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  37.68 
 
 		 738 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  30.36 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1159  hypothetical protein  31.69 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1503 aa  58.9  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0616  hypothetical protein  28.27 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  27.22 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  24.24 
 
 		 644 aa  55.1  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  51.02 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1025  hypothetical protein  30.43 
 
 		 182 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2477  hypothetical protein  35.85 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1518  hypothetical protein  30.43 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.785989  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26.8 
 
 		 3689 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1097  hypothetical protein  28.87 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.68714  decreased coverage  0.00547678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  56.67 
 
 		 1568 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>