More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0744 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  44.66 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 145 aa  94.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.67 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  43.81 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  46.53 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 220 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  42.72 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  44.9 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  48.19 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  48.81 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  51.22 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  42.53 
 
 		 201 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  48.78 
 
 		 269 aa  80.1  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.4 
 
 		 480 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  41.58 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  42.72 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  44.19 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  34.95 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  40.94 
 
 		 320 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  46.34 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.79 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.19 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.39 
 
 		 566 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.39 
 
 		 566 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  45.24 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  44.05 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  35.9 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  40.2 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  38 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  41 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  37.38 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.91 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  39.81 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  37.11 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.61 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  38.24 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  47.56 
 
 		 356 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  37.17 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  44.32 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  47.56 
 
 		 356 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  44.55 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  33.88 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  41.84 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  35.78 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  47.56 
 
 		 356 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.55 
 
 		 393 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  35.78 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  46.34 
 
 		 356 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  35.58 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  46.34 
 
 		 356 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  36.89 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.59 
 
 		 395 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  34.62 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  30.48 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  37.14 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  31.58 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  43 
 
 		 470 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  42.86 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  37.39 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  41.18 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  46.34 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.27 
 
 		 562 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>