231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0627 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
194 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  89.18 
 
 
194 aa  352  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  89.18 
 
 
194 aa  352  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  66.33 
 
 
201 aa  270  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  66.33 
 
 
201 aa  270  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  65.83 
 
 
201 aa  266  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  60.61 
 
 
220 aa  257  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  49.75 
 
 
203 aa  194  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  49.75 
 
 
203 aa  194  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  47.21 
 
 
203 aa  191  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  48.99 
 
 
201 aa  189  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  47.24 
 
 
207 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  49.49 
 
 
203 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  47.24 
 
 
205 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  46.97 
 
 
200 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.98 
 
 
203 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  49.49 
 
 
202 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  47.21 
 
 
216 aa  174  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  44.78 
 
 
212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  44.44 
 
 
205 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  46.7 
 
 
203 aa  170  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  42.71 
 
 
208 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  44.5 
 
 
208 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  46.73 
 
 
230 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  48.35 
 
 
221 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.78 
 
 
209 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  47.78 
 
 
208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  43.94 
 
 
205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  47.25 
 
 
208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  47.25 
 
 
208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  46.7 
 
 
205 aa  164  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  45.86 
 
 
209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  43.43 
 
 
205 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  48.89 
 
 
209 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  42.13 
 
 
201 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  46.77 
 
 
202 aa  160  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  46.7 
 
 
208 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  41.41 
 
 
201 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  45 
 
 
209 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  41.41 
 
 
201 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  45 
 
 
209 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  41.41 
 
 
201 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  43.33 
 
 
207 aa  158  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  47.22 
 
 
206 aa  157  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  44.75 
 
 
209 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  44.75 
 
 
209 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  41.79 
 
 
218 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  44.75 
 
 
209 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  44.75 
 
 
208 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  47.49 
 
 
209 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  44.75 
 
 
209 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  44.13 
 
 
207 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  44.2 
 
 
210 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  44.2 
 
 
208 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  45.45 
 
 
205 aa  155  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  44.75 
 
 
209 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.75 
 
 
209 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  44.13 
 
 
207 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  43.65 
 
 
208 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  44.67 
 
 
202 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  46.37 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  48.04 
 
 
210 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  45.83 
 
 
201 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  42.86 
 
 
209 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  45.6 
 
 
212 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  40.49 
 
 
241 aa  147  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  46.37 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  43.56 
 
 
201 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.56 
 
 
201 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  44.56 
 
 
208 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  41.92 
 
 
209 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  38.16 
 
 
230 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  38.16 
 
 
230 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  43.33 
 
 
206 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  38.65 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.45 
 
 
209 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  42.53 
 
 
184 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  39.79 
 
 
211 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  43.58 
 
 
221 aa  134  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  42.13 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  39.44 
 
 
200 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  43.26 
 
 
203 aa  127  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  42.7 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.98 
 
 
199 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  33 
 
 
218 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  40.78 
 
 
207 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  33.99 
 
 
218 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  48.82 
 
 
140 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.33 
 
 
216 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.78 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  31.67 
 
 
203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  34.92 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.26 
 
 
206 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.09 
 
 
217 aa  106  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  30.94 
 
 
204 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  33.15 
 
 
209 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  38.17 
 
 
216 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  33.7 
 
 
200 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  35.33 
 
 
203 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  37.87 
 
 
228 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>