141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0605 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  51.22 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  50.61 
 
 		 169 aa  164  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  48.5 
 
 		 169 aa  154  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  49.68 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  46.63 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  51.01 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  46.63 
 
 		 169 aa  147  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  46.01 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  39.87 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  39.61 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  39.38 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  40 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  40 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  38.96 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  38.96 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  39.22 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  38.96 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  38.96 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  38.96 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  38.96 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  37.66 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  38.75 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  34.18 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  36.88 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  35.67 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  36.54 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  34.42 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  35.62 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  32.88 
 
 		 168 aa  98.2  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  33.33 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  33.77 
 
 		 290 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  34 
 
 		 289 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  32.91 
 
 		 167 aa  94  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  34.16 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  36.54 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  36.54 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  31.82 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  42.5 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  36.11 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  36.11 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  35.06 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  35.42 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  35.42 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  35.42 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  32.85 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  32.17 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2862  protein of unknown function DUF892  30.67 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.217094  normal  0.674493 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  34.29 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  32 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  29.05 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  31.33 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  31.33 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  31.33 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  31.33 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  31.33 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  31.33 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  31.33 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  31.33 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  31.03 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  28.47 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  31.13 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2857  hypothetical protein  34.4 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  31.62 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  27.14 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  28.67 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  28.67 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  27.53 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  28.57 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  30.99 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  31.62 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  29.41 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  27.97 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  29.45 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  26.57 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  30.43 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  30.88 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  30.5 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  27.94 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  31.62 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1136  hypothetical protein  31.21 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  30.22 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  30.14 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  28.17 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4247  protein of unknown function DUF892  28.67 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1737  hypothetical protein  28.67 
 
 		 166 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.997374  normal  0.0699743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  30.71 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  29.25 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  31.16 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  32.17 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  30.28 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9043  hypothetical protein  28 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4912  hypothetical protein  26.32 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.550913 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>