More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0580 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
328 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  92.68 
 
 
328 aa  634    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  92.68 
 
 
328 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  71.6 
 
 
332 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  67.08 
 
 
327 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  54.21 
 
 
332 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  53.7 
 
 
332 aa  349  4e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  55.31 
 
 
330 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  54.69 
 
 
330 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  54.69 
 
 
330 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  52.98 
 
 
323 aa  342  5e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 
332 aa  341  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  52.2 
 
 
337 aa  338  9e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  52.65 
 
 
332 aa  335  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  52.31 
 
 
329 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  51.4 
 
 
333 aa  330  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 
328 aa  328  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 
332 aa  327  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 
324 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
337 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
327 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
327 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
332 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
332 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  48.45 
 
 
324 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 
324 aa  319  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 
321 aa  318  9e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 
328 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  51.23 
 
 
329 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 
327 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 
328 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  46.46 
 
 
326 aa  315  5e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 
328 aa  315  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 
326 aa  315  7e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 
327 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  51.27 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 
329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 
330 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
331 aa  309  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  48.74 
 
 
329 aa  308  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 
330 aa  306  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  48.61 
 
 
327 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  45.77 
 
 
327 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  45.71 
 
 
333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  49.22 
 
 
337 aa  305  9.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 
329 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  47.84 
 
 
328 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  47.84 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  47.92 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  46.23 
 
 
328 aa  302  5.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  47.68 
 
 
324 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 
329 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
330 aa  298  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  48.26 
 
 
320 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 
327 aa  295  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 
328 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  46.42 
 
 
331 aa  293  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  47.96 
 
 
331 aa  292  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  45.6 
 
 
331 aa  291  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 
328 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  47.58 
 
 
349 aa  290  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 
334 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  45.28 
 
 
328 aa  289  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 
329 aa  289  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 
316 aa  288  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  50.63 
 
 
319 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  46.37 
 
 
354 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  44.51 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 
356 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  48.12 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 
330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  45.51 
 
 
326 aa  282  5.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 
334 aa  282  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  42.32 
 
 
328 aa  282  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  45.65 
 
 
331 aa  279  5e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 
328 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 
328 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  44.69 
 
 
330 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  45.25 
 
 
338 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
318 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 
330 aa  276  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 
330 aa  276  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  47.99 
 
 
329 aa  276  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 
328 aa  275  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  48.15 
 
 
351 aa  275  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>