More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0562 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  73.14 
 
 
446 aa  647  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  96.17 
 
 
444 aa  825  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  96.17 
 
 
444 aa  825  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  100 
 
 
444 aa  894  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  70.25 
 
 
441 aa  632  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  70.43 
 
 
445 aa  624  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  69.41 
 
 
461 aa  595  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  52.97 
 
 
450 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  52.05 
 
 
446 aa  447  1e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  53.6 
 
 
436 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  52.88 
 
 
444 aa  440  1e-122  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  51.15 
 
 
450 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  52.14 
 
 
443 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  52.4 
 
 
449 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  51.68 
 
 
449 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  51.24 
 
 
443 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  51.47 
 
 
443 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  50.69 
 
 
450 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  52.69 
 
 
441 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  50.9 
 
 
443 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  51.21 
 
 
450 aa  416  1e-115  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  48.99 
 
 
435 aa  405  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  49.17 
 
 
462 aa  407  1e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  48.54 
 
 
439 aa  407  1e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  49.1 
 
 
435 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  47.75 
 
 
435 aa  400  1e-110  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  50.94 
 
 
439 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  46.9 
 
 
442 aa  388  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  45.75 
 
 
448 aa  363  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  47.24 
 
 
446 aa  353  3e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  46.4 
 
 
442 aa  353  3e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  47.56 
 
 
442 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  42.92 
 
 
453 aa  346  4e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  44.67 
 
 
445 aa  345  7e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  46.76 
 
 
446 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  46.76 
 
 
446 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  43.01 
 
 
454 aa  340  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  43.65 
 
 
451 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  43.13 
 
 
462 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  42.86 
 
 
461 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  40.73 
 
 
469 aa  322  6e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  2.01302e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  37.35 
 
 
450 aa  303  6e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  36.85 
 
 
420 aa  288  2e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  34.44 
 
 
415 aa  226  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  4.1462e-08  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  35.92 
 
 
443 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  31.54 
 
 
457 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.45 
 
 
427 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.81605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  33.79 
 
 
422 aa  221  2e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  32.85 
 
 
434 aa  221  2e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.79 
 
 
422 aa  221  2e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  35.08 
 
 
435 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  34.18 
 
 
435 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  4.01957e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  33.95 
 
 
421 aa  215  1e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  32.34 
 
 
442 aa  214  2e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  32.21 
 
 
432 aa  213  4e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  30.11 
 
 
432 aa  213  5e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.79 
 
 
428 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  33.96 
 
 
424 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  32.37 
 
 
433 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  32.19 
 
 
428 aa  209  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  32.15 
 
 
433 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.05 
 
 
430 aa  209  9e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  34.94 
 
 
439 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  32.52 
 
 
436 aa  208  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  31.97 
 
 
441 aa  208  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.40509e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  32.34 
 
 
423 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.72 
 
 
426 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  32.42 
 
 
433 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  33.1 
 
 
414 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.65 
 
 
432 aa  206  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.7 
 
 
446 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  32.34 
 
 
423 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  32.18 
 
 
425 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  32.34 
 
 
423 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  29.26 
 
 
451 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.41 
 
 
434 aa  203  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  31.98 
 
 
450 aa  203  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  31.77 
 
 
442 aa  202  1e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.49314e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  32.28 
 
 
430 aa  200  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  31.77 
 
 
442 aa  200  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  31.54 
 
 
442 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.86682e-08  hitchhiker  1.62747e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.77 
 
 
441 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  31.77 
 
 
442 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.14613e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  31.77 
 
 
442 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.78843e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  33.41 
 
 
439 aa  199  8e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  31.51 
 
 
428 aa  199  1e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  31.49 
 
 
431 aa  198  2e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  30.89 
 
 
432 aa  198  2e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.73 
 
 
429 aa  198  2e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.0948e-15  normal 
 
 
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  31.92 
 
 
437 aa  198  2e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  30.7 
 
 
441 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.32022e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  31.32 
 
 
442 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.03609e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  31.92 
 
 
440 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  31.56 
 
 
431 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.91 
 
 
427 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  31.81 
 
 
432 aa  197  4e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  31.54 
 
 
442 aa  197  4e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.08344e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  32.01 
 
 
433 aa  196  5e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  31.81 
 
 
432 aa  196  5e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.09745e-08  hitchhiker  3.39249e-05 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  32.01 
 
 
433 aa  196  5e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>