More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0531 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  83.52 
 
 		 450 aa  758    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 450 aa  908    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  83.52 
 
 		 450 aa  761    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  61.4 
 
 		 451 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  60.59 
 
 		 451 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  58.69 
 
 		 453 aa  500  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  50.91 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  47.87 
 
 		 452 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  46.98 
 
 		 452 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  46.76 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.49 
 
 		 467 aa  362  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  43.49 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.63 
 
 		 456 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 		 450 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.93 
 
 		 451 aa  348  8e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  40.74 
 
 		 450 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.25 
 
 		 444 aa  343  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  42.49 
 
 		 448 aa  336  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  39.77 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  39.03 
 
 		 449 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 470 aa  326  7e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  39.49 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  39.49 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 449 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  39.15 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 		 480 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 		 449 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.44 
 
 		 454 aa  317  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  38.8 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  38.34 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  37.74 
 
 		 444 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  38.11 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  38.11 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  38.11 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  38.11 
 
 		 458 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  38.11 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  37.88 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  37.88 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  37.88 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  35.5 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 		 458 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.42 
 
 		 490 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0090  coproporphyrinogen III oxidase  36.95 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  36.03 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  36.89 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  36.77 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  37.13 
 
 		 457 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 457 aa  293  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0053  coproporphyrinogen III oxidase  36.72 
 
 		 446 aa  293  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59946  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  37.14 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  37.3 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  37.14 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  37.14 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  37.24 
 
 		 444 aa  292  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  39.68 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  36.26 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  37.03 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  39.18 
 
 		 463 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 463 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 463 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 460 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  39 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  39.14 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4514  coproporphyrinogen III oxidase  37.3 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  37.19 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  36.63 
 
 		 457 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  36.09 
 
 		 494 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  34.66 
 
 		 455 aa  286  7e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 		 487 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  36.4 
 
 		 457 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  34.62 
 
 		 484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  35.1 
 
 		 446 aa  282  9e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  38.72 
 
 		 464 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  38.72 
 
 		 464 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  38.72 
 
 		 464 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  35.63 
 
 		 494 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  38.72 
 
 		 464 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  33.57 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  35.73 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  35.73 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  38.5 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  35.73 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  35.73 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  39.33 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  35.81 
 
 		 480 aa  280  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 		 465 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>