248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0469 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  45.03 
 
 		 934 aa  745    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  42.02 
 
 		 925 aa  693    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  94.3 
 
 		 930 aa  1805    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 930 aa  1899    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  40.41 
 
 		 968 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  42.48 
 
 		 936 aa  725    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  42.86 
 
 		 933 aa  711    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  44.02 
 
 		 932 aa  715    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  44.27 
 
 		 912 aa  713    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  66.81 
 
 		 914 aa  1219    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  42.37 
 
 		 931 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  45.14 
 
 		 934 aa  761    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  43.4 
 
 		 933 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  42.49 
 
 		 931 aa  709    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  67.12 
 
 		 893 aa  1224    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  45.55 
 
 		 935 aa  714    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  65.92 
 
 		 943 aa  1253    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  44.68 
 
 		 912 aa  703    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  47.19 
 
 		 931 aa  840    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  46.76 
 
 		 969 aa  741    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  45.21 
 
 		 928 aa  754    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  68.93 
 
 		 936 aa  1241    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  43.02 
 
 		 937 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  44.04 
 
 		 931 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  41.83 
 
 		 968 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  44.85 
 
 		 935 aa  730    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  44.72 
 
 		 949 aa  700    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  44.77 
 
 		 928 aa  746    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  44.6 
 
 		 936 aa  739    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  44.92 
 
 		 934 aa  744    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  44.77 
 
 		 928 aa  746    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  94.41 
 
 		 930 aa  1806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  44.53 
 
 		 953 aa  675    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  44.54 
 
 		 1029 aa  739    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  42.92 
 
 		 941 aa  658    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  41.69 
 
 		 941 aa  607  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  41.58 
 
 		 938 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  38.2 
 
 		 989 aa  555  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.33 
 
 		 924 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  34.68 
 
 		 899 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  39.06 
 
 		 936 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.39 
 
 		 894 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.04 
 
 		 894 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  35.62 
 
 		 902 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 		 898 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.87 
 
 		 900 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.09 
 
 		 905 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  32.92 
 
 		 906 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  35.07 
 
 		 899 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  33.09 
 
 		 900 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  32.19 
 
 		 899 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.59 
 
 		 893 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  31.7 
 
 		 888 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  32.16 
 
 		 856 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.58 
 
 		 864 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  32.28 
 
 		 900 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  33.45 
 
 		 892 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  32.13 
 
 		 900 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  32.28 
 
 		 900 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2766  (protein-PII) uridylyltransferase  46.96 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.66342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  32.07 
 
 		 900 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  32.88 
 
 		 877 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  33.26 
 
 		 891 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.14 
 
 		 887 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  31.57 
 
 		 900 aa  399  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  32.75 
 
 		 899 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  32.53 
 
 		 898 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  31.24 
 
 		 900 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  32.04 
 
 		 881 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  31.81 
 
 		 897 aa  393  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  32.1 
 
 		 890 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  32.1 
 
 		 890 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  32.1 
 
 		 890 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  32.1 
 
 		 890 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 890 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 		 930 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  33.14 
 
 		 859 aa  389  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  32.1 
 
 		 890 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  32.21 
 
 		 890 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.37 
 
 		 930 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.3 
 
 		 930 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.1 
 
 		 890 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  30.24 
 
 		 878 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.97 
 
 		 863 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  32.9 
 
 		 859 aa  386  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  32.1 
 
 		 890 aa  385  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  30.9 
 
 		 900 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  32.34 
 
 		 862 aa  386  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  32.56 
 
 		 892 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  32.22 
 
 		 862 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  32.07 
 
 		 861 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  31.84 
 
 		 898 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  31.89 
 
 		 852 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  32.93 
 
 		 858 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  33.29 
 
 		 858 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  32.32 
 
 		 890 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.18 
 
 		 894 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  32.93 
 
 		 858 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  32.45 
 
 		 890 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  32.45 
 
 		 890 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>