More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0466 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  95.66 
 
 
357 aa  691    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
347 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  95.95 
 
 
357 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.33 
 
 
341 aa  565  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.62 
 
 
341 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.73 
 
 
339 aa  511  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.29 
 
 
342 aa  511  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 
353 aa  481  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 
353 aa  481  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.96 
 
 
353 aa  478  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.96 
 
 
354 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.06 
 
 
332 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.37 
 
 
335 aa  464  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.03 
 
 
347 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.59 
 
 
345 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.53 
 
 
347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.45 
 
 
347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 
347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.89 
 
 
355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 
349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.48 
 
 
348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.89 
 
 
355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 
344 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 
350 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.97 
 
 
350 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 
344 aa  441  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.4 
 
 
350 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 
355 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.68 
 
 
355 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 
354 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 
354 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.18 
 
 
345 aa  431  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 
356 aa  433  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 
344 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.46 
 
 
333 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 
354 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.97 
 
 
354 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 
331 aa  404  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.1 
 
 
339 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 
332 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 
332 aa  333  3e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
337 aa  312  6.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
355 aa  306  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
337 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
328 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
330 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
336 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
336 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
337 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
339 aa  300  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
327 aa  299  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
336 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
337 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
335 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
338 aa  296  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
332 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
351 aa  296  5e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
337 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
332 aa  295  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
332 aa  295  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
332 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
338 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
332 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
329 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
329 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
337 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
329 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
332 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
329 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
331 aa  293  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
332 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
332 aa  292  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
346 aa  292  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
329 aa  292  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
329 aa  292  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
329 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
329 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
336 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
329 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
365 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
329 aa  288  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
327 aa  288  9e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
329 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
337 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
332 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
335 aa  287  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
334 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
334 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
345 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
338 aa  285  7e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
347 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  43.31 
 
 
342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>