131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0395 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32724  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0785  putative heat shock protein DnaJ  89.43 
 
 
227 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  89.43 
 
 
227 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525604  hitchhiker  0.00758559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  71.37 
 
 
235 aa  331  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0737  heat shock protein DnaJ domain protein  68.28 
 
 
227 aa  319  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3389  heat shock protein DnaJ-like  64.5 
 
 
235 aa  298  6e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1801  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.42 
 
 
241 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.06 
 
 
236 aa  190  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1445  DnaJ domain-containing protein  44.21 
 
 
236 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0302292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1401  DnaJ domain-containing protein  44.21 
 
 
236 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.382181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1731  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.16 
 
 
236 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  49.48 
 
 
257 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2105  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.65 
 
 
235 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2019  heat shock protein DnaJ-like  46.52 
 
 
236 aa  174  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  43.22 
 
 
235 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2608  heat shock protein DnaJ domain protein  44.55 
 
 
235 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221974  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.6 
 
 
240 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1897  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.92 
 
 
235 aa  165  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.394264  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  41.1 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.5 
 
 
231 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  40.08 
 
 
241 aa  158  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  44.16 
 
 
241 aa  157  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.16 
 
 
241 aa  157  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.38 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  42.66 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.59 
 
 
246 aa  151  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.19 
 
 
256 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.5 
 
 
251 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1139  heat shock protein DnaJ domain protein  37.19 
 
 
275 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632785  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.12 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  29.77 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.21 
 
 
268 aa  79  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  25.21 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.29 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  26.36 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  30 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  25.63 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  28 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  25.37 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  26.85 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  26.85 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  28.57 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.81 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  24.24 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  24.25 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  28.89 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  24.25 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  24.25 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  24.25 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  24.25 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  25.54 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  23.26 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  25.54 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  25.54 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  25.3 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  25.76 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  24.76 
 
 
259 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  21.93 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  21.93 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  21.93 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  21.93 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  21.93 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  21.93 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  21.93 
 
 
271 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  21.56 
 
 
271 aa  62.8  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  25.96 
 
 
273 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  21.93 
 
 
271 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0826  heat shock protein DnaJ domain protein  27.7 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000315568  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  26.39 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  21.77 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  24.32 
 
 
276 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  23.45 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  23.12 
 
 
256 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  24.15 
 
 
264 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  25 
 
 
284 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  25.62 
 
 
262 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  23.21 
 
 
296 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  25.62 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  23.42 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  21.36 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  25.88 
 
 
284 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  25.62 
 
 
262 aa  55.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  25.62 
 
 
262 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  25.65 
 
 
286 aa  55.1  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  22.77 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  30.77 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  33.85 
 
 
288 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  32.31 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  23.75 
 
 
289 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  21.47 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0827  DnaJ domain-containing protein  21.47 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1034  DnaJ domain-containing protein  21.47 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0627693  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  49.09 
 
 
645 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  26.19 
 
 
273 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03463  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G05400)  37.1 
 
 
519 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000832444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  25.95 
 
 
277 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  25.19 
 
 
277 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  25.19 
 
 
277 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  39.34 
 
 
373 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  35.38 
 
 
375 aa  46.2  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>