More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0265 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  100 
 
 		 163 aa  319  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0237  putative CheW protein  84.77 
 
 		 163 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1585  chemotaxis protein, CheW2  84.77 
 
 		 163 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  40.14 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  40.15 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  40.15 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  37.32 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  38.13 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  37.59 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  38.51 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  33.76 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  38.62 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  39.47 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  35.86 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  32.64 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  90.5  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  33.55 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.55 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.89 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  31.88 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  31.65 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  30.43 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  34.46 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  28.77 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  28.57 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  29.71 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  29.14 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  31.9 
 
 		 171 aa  84  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  31.16 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  35.25 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  31.88 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  30.87 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.58 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  32.14 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  30.41 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  36.23 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  36.23 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  36.23 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  32.67 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  35.51 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  29.71 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  29.93 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  32.37 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  30.07 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  27.66 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  31.88 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  30.82 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  31.33 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  31.88 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  31.65 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  31.65 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  32.62 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  26.43 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.77 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  31.34 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.77 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  32.61 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  27.54 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.77 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.77 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  30.43 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  33.76 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.77 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  30.61 
 
 		 177 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.45 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  30.43 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  28.77 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  28.77 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  28.77 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  28.77 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  25.9 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  32.85 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.77 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  28.57 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  29.8 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.79 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  29.71 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  29.93 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  25.18 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.08 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  30.72 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  33.33 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  31.16 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  26.8 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  30.89 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  31.43 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.45 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.08 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  30.89 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  31.43 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  30.89 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  25.9 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.71 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  28.08 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  31.25 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.43 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  30.37 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  28.08 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  31.25 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>