165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0259 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  84.94 
 
 
353 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  83.51 
 
 
351 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  60.28 
 
 
357 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  64.43 
 
 
363 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  59.55 
 
 
355 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  56.94 
 
 
371 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  52.81 
 
 
356 aa  316  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  51.8 
 
 
368 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  48.86 
 
 
358 aa  291  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  46.89 
 
 
386 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  45.11 
 
 
366 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  46.88 
 
 
367 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  46.89 
 
 
366 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  45.71 
 
 
363 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  44.82 
 
 
366 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  46.18 
 
 
365 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  45.56 
 
 
377 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  45.89 
 
 
365 aa  262  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  46.05 
 
 
379 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  45.35 
 
 
375 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  44.2 
 
 
375 aa  255  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  48.72 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  43.21 
 
 
375 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  44.54 
 
 
390 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  44.54 
 
 
376 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  48.41 
 
 
367 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  45.5 
 
 
369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  37.24 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  52.59 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  50.83 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  44.54 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  51.94 
 
 
361 aa  242  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  40.29 
 
 
366 aa  241  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  45.25 
 
 
351 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  51.85 
 
 
362 aa  239  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  45.56 
 
 
351 aa  238  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  36.25 
 
 
335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  46.49 
 
 
364 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  50.61 
 
 
339 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  35.98 
 
 
335 aa  229  6e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  49.28 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  45.37 
 
 
324 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  39.4 
 
 
402 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  35.69 
 
 
449 aa  209  8e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  30.99 
 
 
515 aa  206  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  36.14 
 
 
323 aa  202  7e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  36.97 
 
 
461 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  30.45 
 
 
504 aa  175  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  34.72 
 
 
370 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  32.67 
 
 
393 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  34.46 
 
 
384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  31.37 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  36.58 
 
 
386 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  31.37 
 
 
388 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  27.79 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  31.62 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  31.15 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  30.75 
 
 
404 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  30.87 
 
 
386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.07 
 
 
394 aa  119  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  31.71 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  34.37 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  31.82 
 
 
360 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  31.04 
 
 
349 aa  112  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  27.5 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  34.25 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  34.22 
 
 
404 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.47 
 
 
385 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  30.08 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  30.65 
 
 
410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  32.26 
 
 
393 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  31.95 
 
 
398 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  28.22 
 
 
387 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  27.05 
 
 
370 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  32.77 
 
 
368 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  26.43 
 
 
370 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  31.04 
 
 
393 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  27.52 
 
 
386 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  32.28 
 
 
384 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  29.11 
 
 
395 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  28.27 
 
 
377 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  34.41 
 
 
376 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  27.92 
 
 
377 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  29.82 
 
 
424 aa  99.8  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  32.88 
 
 
362 aa  99.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  33.51 
 
 
403 aa  99.4  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  28.53 
 
 
395 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  31.32 
 
 
397 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  32.14 
 
 
410 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  32.88 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  31.69 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  30.1 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  32.09 
 
 
358 aa  95.9  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  27.44 
 
 
375 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  30 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  32.1 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  33.24 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  31.55 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>