47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0180 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  100 
 
 		 98 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  96.97 
 
 		 99 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  95.96 
 
 		 99 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  82.65 
 
 		 116 aa  166  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  79.38 
 
 		 102 aa  158  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  74.23 
 
 		 98 aa  147  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  73.2 
 
 		 98 aa  146  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  61.86 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  67.06 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  60.42 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  59.38 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  72.84 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  64.37 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  65.88 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  67.9 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  66.67 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  63.86 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  59.34 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  57.89 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  59.57 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  60.64 
 
 		 105 aa  106  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  60 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  60.98 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  61.73 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  61.73 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  61.73 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  56.82 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  62.5 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  64.56 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  59.26 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  64.56 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  58.97 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  54.32 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  54.32 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1199  chorismate mutase  40.66 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  40.24 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  33.75 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0521  chorismate mutase  31.94 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 358 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.85 
 
 		 358 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.85 
 
 		 358 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  35.9 
 
 		 333 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  38.1 
 
 		 359 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  39.73 
 
 		 375 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2453  hypothetical protein  29.49 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  41.38 
 
 		 374 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 		 375 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>