More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0118 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  67.88 
 
 		 776 aa  838    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 788 aa  1584    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  66.91 
 
 		 729 aa  912    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  90.82 
 
 		 831 aa  1348    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  63.98 
 
 		 744 aa  839    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  62.36 
 
 		 735 aa  875    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  90.75 
 
 		 788 aa  1454    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  41.79 
 
 		 741 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  39.8 
 
 		 776 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  41.65 
 
 		 728 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  42.01 
 
 		 779 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  38.36 
 
 		 833 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  41.14 
 
 		 727 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  41.45 
 
 		 727 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  42.75 
 
 		 728 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  40.81 
 
 		 734 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  41.03 
 
 		 739 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  42.96 
 
 		 714 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  41.56 
 
 		 734 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  39.67 
 
 		 775 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  43.78 
 
 		 714 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  38.75 
 
 		 735 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  41.29 
 
 		 757 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  40.29 
 
 		 720 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  38.72 
 
 		 732 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  39.9 
 
 		 720 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  40.2 
 
 		 768 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  40.87 
 
 		 750 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  36.18 
 
 		 712 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  39.3 
 
 		 724 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  40.84 
 
 		 651 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  39.04 
 
 		 718 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 654 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  38.86 
 
 		 724 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  40.7 
 
 		 691 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  40.61 
 
 		 656 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 770 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  38.19 
 
 		 742 aa  389  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  39.13 
 
 		 723 aa  389  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  39.9 
 
 		 759 aa  386  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  38.26 
 
 		 757 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  36.86 
 
 		 714 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  38.77 
 
 		 763 aa  382  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  38.78 
 
 		 769 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  38.77 
 
 		 750 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  39.18 
 
 		 760 aa  382  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  38.57 
 
 		 707 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  38.58 
 
 		 758 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  38.77 
 
 		 730 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  38.25 
 
 		 759 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  43.45 
 
 		 796 aa  366  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  40 
 
 		 763 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  38.22 
 
 		 744 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  37.1 
 
 		 718 aa  361  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  39.66 
 
 		 658 aa  359  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  37.08 
 
 		 760 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  36.91 
 
 		 765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  36.91 
 
 		 784 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  40.07 
 
 		 626 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  36.69 
 
 		 764 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  38.59 
 
 		 743 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  37.62 
 
 		 669 aa  353  8e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  41.47 
 
 		 810 aa  348  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  39.34 
 
 		 830 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  36.2 
 
 		 728 aa  348  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  39.34 
 
 		 830 aa  347  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  37.63 
 
 		 736 aa  347  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  37.69 
 
 		 733 aa  347  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  39.15 
 
 		 814 aa  343  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  35.4 
 
 		 732 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  37.5 
 
 		 815 aa  340  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  36.79 
 
 		 712 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  35.02 
 
 		 709 aa  336  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 		 648 aa  334  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 		 795 aa  332  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  38.85 
 
 		 750 aa  331  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  35.75 
 
 		 712 aa  330  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.44 
 
 		 776 aa  330  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  38.22 
 
 		 765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38.44 
 
 		 761 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  34.71 
 
 		 755 aa  320  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  38.94 
 
 		 626 aa  321  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  34.14 
 
 		 658 aa  320  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.56 
 
 		 806 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  33.84 
 
 		 712 aa  314  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  37.7 
 
 		 727 aa  313  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  35.41 
 
 		 618 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  34.51 
 
 		 824 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  35.74 
 
 		 905 aa  311  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  34.36 
 
 		 824 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  34.36 
 
 		 668 aa  310  9e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  36.95 
 
 		 699 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  32.54 
 
 		 626 aa  304  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  32.66 
 
 		 680 aa  302  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  32.34 
 
 		 811 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  34.94 
 
 		 751 aa  301  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  33.77 
 
 		 692 aa  300  9e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  32.83 
 
 		 602 aa  298  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  31.02 
 
 		 880 aa  296  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.18 
 
 		 727 aa  296  9e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>