162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0085 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0085  dehydratase  100 
 
 
343 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2633  dehydratase  88.63 
 
 
343 aa  614  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0973  MaoC family protein  88.34 
 
 
343 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  82.16 
 
 
344 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3523  hypothetical protein  78.78 
 
 
346 aa  551  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.839256  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2871  putative thiol ester dehydrase/isomerase  76.02 
 
 
343 aa  532  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0813  hypothetical protein  67.64 
 
 
343 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5003  dehydratase  65.03 
 
 
349 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1430  dehydratase  62.93 
 
 
349 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1201  MaoC-like dehydratase  62.54 
 
 
353 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3627  MaoC domain protein dehydratase  64.87 
 
 
348 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3940  dehydratase  65.25 
 
 
348 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3781  dehydratase  63.1 
 
 
348 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4037  MaoC domain protein dehydratase  63.17 
 
 
348 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0913  dehydratase  59.71 
 
 
352 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4465  dehydratase  61.14 
 
 
347 aa  411  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4075  MaoC domain protein dehydratase  62.25 
 
 
348 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1326  MaoC domain protein dehydratase  59.03 
 
 
359 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4172  dehydratase  58.86 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1970  dehydratase  61.02 
 
 
353 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0961823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4149  MaoC-like dehydratase  49.14 
 
 
359 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4428  MaoC-like dehydratase  49.43 
 
 
353 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000912806  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  28.39 
 
 
344 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  38.75 
 
 
169 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  34.81 
 
 
168 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  36.55 
 
 
173 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  36.3 
 
 
149 aa  89.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  34.93 
 
 
172 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  35.14 
 
 
150 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1584  dehydratase  38.78 
 
 
166 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0906655  hitchhiker  0.00294488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  33.56 
 
 
150 aa  87  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  32.65 
 
 
150 aa  87  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  33.1 
 
 
172 aa  87  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  33.77 
 
 
152 aa  86.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  34.48 
 
 
168 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  36.31 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  32.65 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  34.69 
 
 
150 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  33.11 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  30.67 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  31.25 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  31.25 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  34.69 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  30.67 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  32.65 
 
 
152 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  35.22 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  32.65 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  36.3 
 
 
169 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4181  Acyl dehydratase-like protein  27.22 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  33.33 
 
 
149 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6829  hypothetical protein  28.06 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  32.26 
 
 
175 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  32.26 
 
 
175 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  32.26 
 
 
175 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  32.26 
 
 
175 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  32.26 
 
 
175 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  32.26 
 
 
175 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  32.26 
 
 
175 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  33.11 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  31.29 
 
 
150 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4501  dehydratase  34.93 
 
 
169 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  34.67 
 
 
161 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1615  acyl dehydratase-like protein  26.67 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  34.93 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  31.13 
 
 
156 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  30.19 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0183  hypothetical protein  25.85 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0192  hypothetical protein  25.85 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  31.51 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0172  hypothetical protein  26.44 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  31.51 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0834  putative dehydratase  34.25 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0152637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  31.51 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  29.61 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  31.61 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  30.61 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  33.56 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4299  dehydratase  27.83 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313691  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  32.19 
 
 
171 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  32.88 
 
 
169 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  31.01 
 
 
159 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  27.74 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  31.08 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  31.47 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  31.47 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  31.47 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  27.1 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  31.47 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  29.93 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  31.51 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  29.61 
 
 
155 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  30.61 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0222  hypothetical protein  25.62 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  0.0567113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0445  hypothetical protein  25.15 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2185  MaoC domain protein dehydratase  36 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0004362  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  30.87 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  30 
 
 
153 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  31.21 
 
 
161 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  31.21 
 
 
161 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  31.21 
 
 
161 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>