168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0071 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  100 
 
 		 219 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  85.84 
 
 		 242 aa  339  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  84.02 
 
 		 238 aa  333  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  59.35 
 
 		 244 aa  244  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  60 
 
 		 243 aa  208  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  53.42 
 
 		 245 aa  194  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  42.65 
 
 		 714 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  41.23 
 
 		 714 aa  168  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  50.72 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  35.24 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  41.94 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  37.11 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  34.29 
 
 		 224 aa  101  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  33.66 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  38.55 
 
 		 267 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  37.04 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  40.24 
 
 		 722 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  33.5 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  31.84 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  36.02 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  36.02 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  35.36 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  34.13 
 
 		 282 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  34.5 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  35.68 
 
 		 251 aa  88.6  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.1 
 
 		 746 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  32.24 
 
 		 238 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  33.72 
 
 		 265 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.54 
 
 		 722 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  32.18 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.73 
 
 		 722 aa  81.6  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  35.59 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.84 
 
 		 717 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.14 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  29.7 
 
 		 713 aa  79  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  33.18 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  38.84 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  34.3 
 
 		 716 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  33.53 
 
 		 704 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.34 
 
 		 713 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  31.91 
 
 		 717 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  33.8 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  35.15 
 
 		 738 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  29.7 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.81 
 
 		 717 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  28.1 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  35.51 
 
 		 716 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  31.6 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  34.95 
 
 		 720 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.5 
 
 		 705 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.21 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  30.11 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  35.14 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6067  SNARE associated Golgi protein  37.19 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0460  hypothetical protein  32 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.955509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  35.04 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  34.43 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.33 
 
 		 712 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.4 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  29.32 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  34.96 
 
 		 623 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  32.92 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  27.39 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  26.97 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  33.77 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  28.3 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  28.3 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  27.59 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  27.27 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  32.98 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  30.32 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  25.64 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  30.77 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  29.95 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  37.14 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  20.83 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  28.17 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  28.17 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  31.91 
 
 		 267 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  28.17 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  28.21 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  29.86 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.85 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  25.93 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  25.93 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  30.97 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  27.01 
 
 		 304 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  23.75 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  31.61 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  29.19 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  28.57 
 
 		 149 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  25.19 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  25.19 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>