More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0064 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 369 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  84.51 
 
 		 367 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  84.24 
 
 		 367 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  61.83 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  61.24 
 
 		 353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  66.27 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  64.19 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.62 
 
 		 374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  53.06 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  52.63 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  52.19 
 
 		 364 aa  345  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  53.28 
 
 		 370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  52.34 
 
 		 358 aa  343  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  55.65 
 
 		 365 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  56.01 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  54.22 
 
 		 615 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  56.14 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  54.55 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  49.33 
 
 		 464 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  51.91 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.76 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.71 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.01 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  52.68 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  51.32 
 
 		 404 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  51.32 
 
 		 441 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  53.67 
 
 		 405 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  57.27 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  44.31 
 
 		 350 aa  308  9e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.06 
 
 		 367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.6 
 
 		 344 aa  302  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  50.73 
 
 		 383 aa  301  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  51.61 
 
 		 371 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  53.47 
 
 		 347 aa  298  8e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  54.23 
 
 		 350 aa  285  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 		 354 aa  285  8e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  52.56 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  48.34 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  51.02 
 
 		 376 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  48.83 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  46.76 
 
 		 415 aa  276  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  37.11 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.92 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  42.6 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  37.96 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  45.9 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 		 383 aa  238  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.85 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  42.22 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  42.9 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.9 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  40.45 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  40.45 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  46.11 
 
 		 368 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  46.11 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  46.11 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  45.48 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  40.44 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  42.32 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  42.39 
 
 		 352 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  45.79 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  45.79 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  45.79 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  45.79 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  42.01 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.61 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  41.19 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.23 
 
 		 353 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  39.31 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  35.58 
 
 		 386 aa  225  8e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.45 
 
 		 372 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  41.05 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  42.81 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  40 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  42.14 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.45 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  41.05 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  41.46 
 
 		 419 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  41.05 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  38.44 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  40.31 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.86 
 
 		 375 aa  222  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.18 
 
 		 355 aa  222  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.32 
 
 		 365 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  41.36 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  41.14 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.54 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.69 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.84 
 
 		 372 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  44.72 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  35.99 
 
 		 360 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  35.86 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  42.26 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  38.44 
 
 		 368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 		 383 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  41.82 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  42.26 
 
 		 350 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>