44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0042 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  357  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  91.48 
 
 
176 aa  327  5e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  91.48 
 
 
176 aa  327  5e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  66.04 
 
 
182 aa  223  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  57.71 
 
 
175 aa  206  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  58.79 
 
 
177 aa  193  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  59.48 
 
 
175 aa  183  1e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  46.45 
 
 
168 aa  146  1e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  39.35 
 
 
173 aa  112  4e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  35.2 
 
 
175 aa  101  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  34.87 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  34.88 
 
 
167 aa  94  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  36.84 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  33.53 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  30.9 
 
 
204 aa  90.1  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  30.91 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  28.77 
 
 
227 aa  89  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  31.03 
 
 
167 aa  88.2  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  31.03 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  28.08 
 
 
227 aa  82.8  2e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  33.14 
 
 
169 aa  82  4e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  32.73 
 
 
165 aa  80.9  8e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  32.74 
 
 
169 aa  79.7  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  78.2  5e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  30.3 
 
 
199 aa  77  1e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  76.3  2e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  29.46 
 
 
191 aa  76.6  2e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  37.4 
 
 
169 aa  75.1  5e-13  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  27.16 
 
 
209 aa  72.4  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  31.55 
 
 
162 aa  72.8  3e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  33.59 
 
 
169 aa  72  4e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  29.27 
 
 
206 aa  67.8  7e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  29.24 
 
 
178 aa  67.8  7e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  28.05 
 
 
203 aa  67  1e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  28.93 
 
 
241 aa  67  1e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  26.95 
 
 
167 aa  65.5  4e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  31.21 
 
 
227 aa  65.1  4e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  31.21 
 
 
227 aa  65.1  5e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  30.12 
 
 
164 aa  64.7  7e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  29.3 
 
 
225 aa  62.4  3e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  28.3 
 
 
165 aa  48.5  4e-05  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1438  hypothetical protein  24.22 
 
 
165 aa  47.8  9e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  23.81 
 
 
166 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  22.14 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.577158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>