More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0034 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1376  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  98.24 
 
 
340 aa  688    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0300827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0044  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  97.94 
 
 
340 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0034  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
340 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  83.24 
 
 
340 aa  605  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3240  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  85.88 
 
 
340 aa  593  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0114  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  85.59 
 
 
340 aa  592  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918447 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3459  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  82.94 
 
 
340 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  77.49 
 
 
341 aa  557  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  76.02 
 
 
341 aa  541  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.12 
 
 
359 aa  515  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2718  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.15 
 
 
341 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
344 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
344 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.09 
 
 
344 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.4 
 
 
344 aa  501  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.22 
 
 
345 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.22 
 
 
344 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.33 
 
 
344 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.33 
 
 
344 aa  497  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.5 
 
 
344 aa  492  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.62 
 
 
357 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.03 
 
 
344 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.44 
 
 
344 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.84 
 
 
344 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.62 
 
 
344 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.73 
 
 
344 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.33 
 
 
344 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.73 
 
 
344 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.73 
 
 
344 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.73 
 
 
344 aa  482  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.73 
 
 
344 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.84 
 
 
344 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.03 
 
 
344 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.84 
 
 
344 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.14 
 
 
344 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4618  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.26 
 
 
342 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.65 
 
 
345 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2876  aspartate semialdehyde dehydrogenase  64.99 
 
 
341 aa  462  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.07 
 
 
342 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.67 
 
 
343 aa  455  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.83 
 
 
336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0944  aspartate semialdehyde dehydrogenase  61.14 
 
 
336 aa  433  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1717  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.99 
 
 
347 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.806069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  61.31 
 
 
339 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_002978  WD0954  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.12 
 
 
344 aa  394  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.12 
 
 
340 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.19 
 
 
348 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.27 
 
 
349 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.19 
 
 
341 aa  363  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
349 aa  362  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.93 
 
 
340 aa  362  4e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  56.59 
 
 
348 aa  359  5e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  55.42 
 
 
340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.42 
 
 
342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.17 
 
 
339 aa  352  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.87 
 
 
339 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.87 
 
 
340 aa  349  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.87 
 
 
340 aa  349  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.82 
 
 
341 aa  348  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  51.51 
 
 
340 aa  349  5e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.01 
 
 
340 aa  347  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.17 
 
 
339 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.42 
 
 
341 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.82 
 
 
336 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.71 
 
 
340 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.22 
 
 
340 aa  344  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.87 
 
 
339 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.9 
 
 
340 aa  342  7e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.11 
 
 
338 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.19 
 
 
339 aa  338  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.19 
 
 
339 aa  338  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.71 
 
 
340 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.2 
 
 
344 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.82 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  53.85 
 
 
339 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.9 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.56 
 
 
338 aa  335  7e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0800  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  50.6 
 
 
340 aa  334  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.76 
 
 
340 aa  333  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.92 
 
 
340 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2443  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.71 
 
 
338 aa  331  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000737036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.66 
 
 
337 aa  331  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1484  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  51.81 
 
 
338 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0171916  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0940  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.61 
 
 
340 aa  330  2e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.281567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1270  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.34 
 
 
338 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000102592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.94 
 
 
333 aa  329  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.85 
 
 
332 aa  329  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.705444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0350  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.27 
 
 
334 aa  329  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.97 
 
 
338 aa  329  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.81 
 
 
338 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000971394  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2308  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.81 
 
 
338 aa  328  6e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000121331  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
338 aa  328  7e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2744  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.41 
 
 
338 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000610142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1615  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.41 
 
 
338 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000415846  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2761  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.41 
 
 
338 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.41 
 
 
338 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000159168  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1393  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  51.82 
 
 
332 aa  326  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>