25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0022 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  74.82 
 
 		 283 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  73.06 
 
 		 296 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  55.6 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  48.32 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  39.85 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  33.57 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  33.21 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  32.59 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  31.62 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  30.82 
 
 		 358 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  31.46 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  29.93 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  31.2 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  29.96 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  28.94 
 
 		 340 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  30.35 
 
 		 341 aa  85.9  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  30.8 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  27.68 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  29.41 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  28.89 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  26.62 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  25 
 
 		 353 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  26.69 
 
 		 384 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  25.31 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>