More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0002 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  95.94 
 
 		 455 aa  848    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  95.94 
 
 		 455 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 461 aa  936    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  71.31 
 
 		 470 aa  675    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  76.11 
 
 		 448 aa  689    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  64.35 
 
 		 460 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  60.13 
 
 		 475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.81 
 
 		 519 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  52.14 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  52.14 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  52.56 
 
 		 452 aa  461  9.999999999999999e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  52.58 
 
 		 482 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  51.64 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  50.11 
 
 		 460 aa  440  9.999999999999999e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.37 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.22 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  42.8 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  42.8 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  42.8 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  42.35 
 
 		 498 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  44.42 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  43.34 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  44.86 
 
 		 475 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  45.05 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  44 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  40.26 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.1 
 
 		 447 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  43.97 
 
 		 472 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  41.14 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  41.14 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  41.14 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  44.98 
 
 		 475 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  41.14 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  41.36 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  41.14 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  44.23 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  40.92 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.92 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  42.32 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  40.6 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  45.15 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.53 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  40.97 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  45.3 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  40.71 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  40.98 
 
 		 446 aa  372  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  41.87 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  41.19 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  42.05 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  42.05 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.89 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000009849  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  41.98 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.57 
 
 		 454 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  39.05 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  38.66 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  40.44 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  44.17 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  42.28 
 
 		 466 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  42.28 
 
 		 466 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  42.28 
 
 		 466 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  41.98 
 
 		 467 aa  364  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  42.28 
 
 		 466 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  41.98 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.98 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  41.98 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.43 
 
 		 442 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  41.98 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  41.98 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  41.65 
 
 		 465 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  41.98 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  41.98 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.04 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  41.88 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  41.88 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 		 459 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  40.86 
 
 		 457 aa  362  6e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  40.86 
 
 		 457 aa  362  6e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.49 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  42.28 
 
 		 466 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.26 
 
 		 439 aa  362  8e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0001  chromosomal replication initiation protein  42.04 
 
 		 506 aa  362  9e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  43.53 
 
 		 451 aa  360  4e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.39 
 
 		 461 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  43.53 
 
 		 451 aa  360  4e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.04 
 
 		 464 aa  360  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0001  chromosomal replication initiation protein  45.18 
 
 		 498 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  41.35 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  41.58 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0001  chromosomal replication initiation protein  39.6 
 
 		 506 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0129481  hitchhiker  0.0000000143408 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  42.27 
 
 		 524 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000504678  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.58 
 
 		 469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  41.76 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  42 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  41.74 
 
 		 465 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.38 
 
 		 461 aa  356  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  41.7 
 
 		 462 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  41.7 
 
 		 460 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>