79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0024 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0024  RepA-related protein  100 
 
 		 310 aa  633  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0364  repA-related protein  55.63 
 
 		 352 aa  321  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3890  replication protein  39.27 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.353043  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6459  putative replication protein  40.07 
 
 		 414 aa  191  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.34546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3681  replication protein  39.93 
 
 		 418 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3469  replication protein  39.4 
 
 		 426 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235801  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5338  plasmid replication initiator protein-like protein  34.75 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5168  plasmid replication initiator protein-like protein  34.81 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6986  hypothetical protein  32.62 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3469  hypothetical protein  62.96 
 
 		 139 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0523  replication protein A  33.71 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1485  putative replication initiator and transcription repressor protein  33.1 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1263  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.97 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1878  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  33.33 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31110  putative replication initiator and transcriptional repressor protein  32.96 
 
 		 442 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000673493  unclonable  2.75454e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3526  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.91 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2798  replication protein A  33.21 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2933  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.14 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1254  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.96 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2789  hypothetical protein  29.45 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0132  putative replication protein A  31.58 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303306  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3370  putative replication protein A  31.58 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3683  plasmid replication initiator-like protein  31.75 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2606  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.02 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3024  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.43 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2721  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.43 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3589  plasmid replication initiator protein-like protein  32.39 
 
 		 401 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2653  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.21 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585943  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1288  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  32.96 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4219  hypothetical protein  30.71 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2620  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  30.96 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0239154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0686  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.48 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0458  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.03 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.365909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3772  hypothetical protein  26.74 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0602576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3558  replication protein A  31.49 
 
 		 394 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3817  putative plasmid replication protein A  31.2 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7731  putative plasmid replication protein A  31.03 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3731  replication protein A  30.66 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3076  replication protein A  30.37 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1985  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.84 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397497  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1607  replication protein A  33.07 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.288709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3854  hypothetical protein  30.11 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1034  putative replication protein  29.7 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3347  putative replication protein A  30.11 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.632364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0710  replication protein A  29.24 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3184  replication protein A  29.24 
 
 		 391 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7431  putative replication protein A  29.52 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35980  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  30.97 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3531  replication protein A  29.56 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0674076  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1204  replication protein A  29.56 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2086  Plasmid replication initiator protein-like protein  29.48 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2329  putative replication initiator and transcription repressor protein  30.97 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4166  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.84 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0364  putative replication protein A  30.26 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3842  replication protein A  32.18 
 
 		 370 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1142  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.4 
 
 		 270 aa  95.9  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3015  replication protein A  29.26 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2624  putative replication protein A  29.12 
 
 		 294 aa  95.9  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1512  replication protein A  28.83 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4015  replication protein A  29.66 
 
 		 384 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4401  plasmid replication initiator protein-like protein  32.06 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4241  hypothetical protein  28.52 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779681 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3179  replication protein A  30.28 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4988  plasmid replication initiator protein-like protein  27.48 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3908  putative replication protein A  29.96 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_6257  plasmid replication initiator protein RepA  27.7 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0332659  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4081  hypothetical protein  27.7 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4266  hypothetical protein  29.59 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932297  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0581  replication protein A  28.16 
 
 		 379 aa  89.4  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0547768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2817  plasmid replication initiator protein-like  25.27 
 
 		 410 aa  88.6  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.03841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3863  hypothetical protein  25.46 
 
 		 393 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0846  replication protein A  29.12 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0122468 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6268  hypothetical protein  26.69 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0711171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2782  Replication initiator protein A  27.38 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2399  hypothetical protein  26.76 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7398  hypothetical protein  25.08 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0352  hypothetical protein  28.87 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0981  putative replication protein A  29.01 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3468  hypothetical protein  75 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>