98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0013 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0013  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  153  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298502  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  66.15 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  70.37 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  62.75 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3256  Fis family transcriptional regulator  68.18 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0578977  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  49.12 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  52.73 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  47.27 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  51.11 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  41.82 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  41.82 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  43.64 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  45.45 
 
 		 197 aa  51.6  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  47.17 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  52.38 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  45.45 
 
 		 196 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  41.82 
 
 		 184 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  33.33 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  39.24 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  50.98 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  50.98 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  50.98 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  50.98 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  43.64 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  44.9 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  45.28 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  41.82 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  41.82 
 
 		 198 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  50.94 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  47.17 
 
 		 209 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  55.81 
 
 		 218 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  50.94 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  34.18 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  49.06 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  43.33 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  43.4 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  45.45 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  41.18 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  41.18 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  39.62 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  41.18 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  45.45 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  41.18 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  45.45 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  41.18 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  41.18 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  40.74 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  41.18 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  41.18 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  44.83 
 
 		 190 aa  43.5  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  41.51 
 
 		 209 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  49.02 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  55 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  39.68 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  52.27 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  39.68 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  45.45 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  43.64 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  35.85 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  40.35 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  45.65 
 
 		 613 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  45.28 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  42.11 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  45.28 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  40 
 
 		 203 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  45.45 
 
 		 204 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  46.34 
 
 		 185 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  46.43 
 
 		 228 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  38.89 
 
 		 184 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  38.6 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  43.86 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1190  invertase/recombinase protein  43.64 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.262529  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  40.91 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  40.35 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  53.85 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  43.14 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  48.78 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  38.6 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  43.64 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  52.38 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  46.67 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  44.19 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  41.51 
 
 		 324 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  34.38 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  41.18 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  37.25 
 
 		 186 aa  40  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  40.35 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  43.4 
 
 		 309 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  41.07 
 
 		 515 aa  40  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  39.22 
 
 		 194 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>