More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0005 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  100 
 
 		 708 aa  1451    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  40.69 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  38.76 
 
 		 983 aa  156  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.3 
 
 		 307 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1055  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 		 307 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0151578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0539  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 307 aa  127  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 311 aa  112  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 672 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 		 327 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 		 337 aa  105  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.03 
 
 		 326 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 313 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.8 
 
 		 326 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.64 
 
 		 326 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.21 
 
 		 326 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 321 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 597 aa  100  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 299 aa  99.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 1177 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 1177 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 230 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 233 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 367 aa  97.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 326 aa  97.1  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 930 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 		 313 aa  95.1  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.4 
 
 		 321 aa  94.7  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 		 292 aa  94.7  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 333 aa  94.7  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 1035 aa  94.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 573 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 294 aa  94  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  29.96 
 
 		 294 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 		 235 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 235 aa  93.2  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 373 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 390 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 265 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 288 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 		 255 aa  91.3  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  41.59 
 
 		 334 aa  91.3  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3188  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 299 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 		 353 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.35 
 
 		 294 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 		 289 aa  89.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 		 318 aa  89  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 		 727 aa  89  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 373 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 301 aa  88.6  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 581 aa  88.2  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 316 aa  87.8  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  30.84 
 
 		 316 aa  87.8  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.67 
 
 		 312 aa  87.8  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  28.63 
 
 		 355 aa  87.8  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 303 aa  87.4  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 326 aa  87.4  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 		 300 aa  87  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 320 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 1250 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 		 746 aa  86.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 		 294 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 		 312 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 		 283 aa  86.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  24 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.6 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  23.49 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.09 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  31.93 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  30.6 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 		 605 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  41.53 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.13 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.07 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 337 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 348 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  25.7 
 
 		 341 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 289 aa  84  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 331 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 322 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  36.75 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 268 aa  82.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>