70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3789 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  40.34 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  40.12 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  45.21 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  45.89 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  39.01 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  37.82 
 
 		 245 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  43.84 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  40.25 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  45.21 
 
 		 179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  43.05 
 
 		 179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  37.79 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  41.06 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  36.56 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  40.22 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  35.45 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  38.96 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  38.36 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  40.29 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  36.16 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  38.89 
 
 		 174 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  35.64 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  39.75 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  43.36 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  39.75 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  39.13 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  39.13 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  39.75 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  38 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  38 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  37.41 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  40.28 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  33.15 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  36.55 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  39.39 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  35.54 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  36.81 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  36 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  51.25 
 
 		 367 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  35.96 
 
 		 113 aa  99  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  33.08 
 
 		 182 aa  94.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  37.01 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  33.82 
 
 		 160 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  26.19 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  33.33 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  28.23 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  31.11 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  27.55 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  28.28 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  25.38 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  25.38 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  30.61 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1880  SH3 type 3 domain-containing protein  36.54 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  26.4 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  26.03 
 
 		 556 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  30.19 
 
 		 532 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  27.59 
 
 		 370 aa  44.7  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1219  hypothetical protein  38.81 
 
 		 268 aa  44.7  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1236  hypothetical protein  34.09 
 
 		 246 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  28.85 
 
 		 532 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.82 
 
 		 476 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2044  hypothetical protein  36.36 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.74668  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0258  hypothetical protein  27.55 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.41 
 
 		 657 aa  42  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.79 
 
 		 616 aa  42  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2861  SH3 type 3 domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000301098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3845  SH3 domain-containing protein  30.88 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000383374  hitchhiker  0.0000000226441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  24.78 
 
 		 391 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2431  SH3, type 3  30 
 
 		 227 aa  40.8  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  29.35 
 
 		 503 aa  41.2  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>