More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3774 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
531 aa  1021    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  39.2 
 
 
536 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  38.97 
 
 
536 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  39.05 
 
 
541 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  39.85 
 
 
557 aa  324  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  38.02 
 
 
536 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  38.86 
 
 
532 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  38.86 
 
 
532 aa  309  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  37.07 
 
 
535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  37.81 
 
 
536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  37.75 
 
 
534 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  38.35 
 
 
532 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  38.26 
 
 
540 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  37.96 
 
 
543 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
541 aa  276  6e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  39.42 
 
 
556 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  37.23 
 
 
528 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  36.84 
 
 
550 aa  273  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  38.09 
 
 
534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  36.22 
 
 
534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  39.92 
 
 
525 aa  266  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  37.85 
 
 
576 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  36.59 
 
 
502 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  36.25 
 
 
543 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  39.16 
 
 
553 aa  263  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  38.22 
 
 
523 aa  262  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  38.22 
 
 
523 aa  262  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  36.9 
 
 
567 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  36.9 
 
 
567 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  34.1 
 
 
537 aa  236  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  37.21 
 
 
566 aa  236  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  40.12 
 
 
497 aa  223  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  40.12 
 
 
495 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  36.72 
 
 
508 aa  216  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  29.63 
 
 
472 aa  208  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  39.36 
 
 
495 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  40.04 
 
 
495 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  28.45 
 
 
488 aa  205  1e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  27.79 
 
 
501 aa  203  5e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  33.46 
 
 
542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  35.1 
 
 
528 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.69 
 
 
516 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.46 
 
 
573 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  38.12 
 
 
524 aa  190  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  36.44 
 
 
487 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  34.02 
 
 
522 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  33.1 
 
 
507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  33.8 
 
 
507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 
525 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  34.29 
 
 
507 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  34.74 
 
 
477 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  32.69 
 
 
521 aa  177  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  32.77 
 
 
588 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 
529 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  31.74 
 
 
529 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 
529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  31.66 
 
 
506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 
529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 
529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 
521 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  31.69 
 
 
521 aa  171  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  32.66 
 
 
511 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  32.58 
 
 
512 aa  169  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  32.43 
 
 
511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  30.96 
 
 
506 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.2 
 
 
509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  35.82 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  30.44 
 
 
512 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  30.44 
 
 
512 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  33.12 
 
 
505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  29.94 
 
 
553 aa  163  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  33.59 
 
 
528 aa  163  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  30.44 
 
 
512 aa  163  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  30.44 
 
 
512 aa  163  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  37.04 
 
 
509 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  30.24 
 
 
512 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  33.18 
 
 
522 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  30.82 
 
 
519 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  31.96 
 
 
537 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  31.1 
 
 
509 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.27 
 
 
509 aa  160  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  30.17 
 
 
518 aa  159  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 
509 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  32.51 
 
 
520 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 
511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  29.64 
 
 
515 aa  157  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  29.84 
 
 
567 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 
504 aa  156  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  30.92 
 
 
521 aa  156  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  35.52 
 
 
550 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  32.85 
 
 
507 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  29.61 
 
 
510 aa  155  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  31.39 
 
 
520 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  30.99 
 
 
506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  30.03 
 
 
513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  30.22 
 
 
505 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  30.43 
 
 
505 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>