More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3773 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  615  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  51.06 
 
 		 319 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  48.03 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  53.6 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  43.28 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  38.79 
 
 		 357 aa  208  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  43.92 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  37.65 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  41.72 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  41.64 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  39.56 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  39.87 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  39.93 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  41.49 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  43.44 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  43.44 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  38.55 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  43.26 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  37.27 
 
 		 374 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  38.96 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  43.42 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  38.65 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  44.26 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  45.81 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  38.82 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  39.13 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.54 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  48.17 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  37.9 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  40.98 
 
 		 314 aa  185  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  38.56 
 
 		 384 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  50.65 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.07 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  42.23 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  41.52 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  48.2 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  37.46 
 
 		 391 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  37.28 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  39.18 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  39.18 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  39.18 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  41.57 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  39.31 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  39.18 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  39.18 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  39.18 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  39.18 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  42.97 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  43.86 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  36.99 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 		 389 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  41.03 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  38.24 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  41.03 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 		 291 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  34.81 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  38.39 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.13 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  37.74 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  36.84 
 
 		 275 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  39.58 
 
 		 285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.8 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  40.24 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  33.48 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  35.84 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  36.19 
 
 		 273 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  35.52 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  39.66 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  40.52 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  39.22 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  36.67 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  39.44 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  41.26 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  40.93 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  35.74 
 
 		 258 aa  156  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  40.08 
 
 		 282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  32.16 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  50.64 
 
 		 420 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  38.1 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1184  CBS domain-containing protein  37.63 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  41.18 
 
 		 439 aa  155  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  38.1 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.44 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  39.15 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.04 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  40.68 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.04 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.04 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.04 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  34.46 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.04 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.04 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  36.94 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.04 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  37.02 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>