More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3772 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  381  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  56.3 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  51.76 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  54.2 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  51.03 
 
 		 158 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  51.03 
 
 		 158 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  50.61 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  55.93 
 
 		 168 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  48.25 
 
 		 171 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  56.91 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  48.24 
 
 		 161 aa  121  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  44.17 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  53.85 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  47.4 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  50.69 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  54.55 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  47.65 
 
 		 161 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  46.11 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  52.1 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  47.65 
 
 		 161 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  39.52 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  53.28 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  44.63 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  50.32 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  51.67 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  45.51 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  45.81 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  53.33 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  53.17 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  44.57 
 
 		 169 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  45.81 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  48.31 
 
 		 159 aa  104  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  47.62 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  50.83 
 
 		 161 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  48.31 
 
 		 159 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  47.46 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  46.72 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  55.17 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  47.55 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  41.13 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  46.36 
 
 		 154 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  49.17 
 
 		 154 aa  101  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  42.5 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  48.36 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  53.85 
 
 		 167 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  42.57 
 
 		 158 aa  99.4  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  99.4  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  42.57 
 
 		 165 aa  99.4  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  41.45 
 
 		 160 aa  98.6  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  45.69 
 
 		 154 aa  98.2  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  44.16 
 
 		 160 aa  97.8  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  47.11 
 
 		 174 aa  97.8  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  45.69 
 
 		 154 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  44.83 
 
 		 154 aa  97.8  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  44.17 
 
 		 149 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  45.04 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  44.92 
 
 		 158 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  40.13 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  43.97 
 
 		 161 aa  95.9  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  43.97 
 
 		 161 aa  95.9  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  40.97 
 
 		 157 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  47.46 
 
 		 157 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  47.46 
 
 		 157 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  47.46 
 
 		 157 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  47.46 
 
 		 157 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  41.91 
 
 		 154 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  47.46 
 
 		 157 aa  95.1  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  44.14 
 
 		 301 aa  94.7  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  94.7  8e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  44.62 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  46.55 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  45.53 
 
 		 157 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  42.02 
 
 		 154 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  55.56 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  41.79 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  47.01 
 
 		 137 aa  93.2  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  43.8 
 
 		 153 aa  93.2  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  43.59 
 
 		 149 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  40.48 
 
 		 167 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1182  protein of unknown function UPF0054  45.83 
 
 		 161 aa  92.4  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  45.08 
 
 		 189 aa  91.3  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  41.94 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  37.79 
 
 		 156 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  39.1 
 
 		 156 aa  90.9  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  48.28 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  45.69 
 
 		 171 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  48.28 
 
 		 155 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  48.28 
 
 		 155 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  48.28 
 
 		 155 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  44.07 
 
 		 158 aa  89.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  48.67 
 
 		 156 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  48.28 
 
 		 155 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  48.28 
 
 		 155 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  48.28 
 
 		 155 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  45 
 
 		 149 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  44.17 
 
 		 156 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  42.28 
 
 		 158 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  48.28 
 
 		 155 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  41.67 
 
 		 153 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  44.54 
 
 		 152 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>