More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3684 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  100 
 
 
542 aa  1060    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 
1406 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 
697 aa  279  9e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.33 
 
 
1764 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  35.92 
 
 
725 aa  253  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  35.14 
 
 
695 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  36.4 
 
 
700 aa  248  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  36.6 
 
 
656 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  34.72 
 
 
648 aa  239  9e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  36.55 
 
 
530 aa  238  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  30.08 
 
 
652 aa  227  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.84 
 
 
530 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  34.84 
 
 
677 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  37.24 
 
 
663 aa  216  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  31.93 
 
 
669 aa  213  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  34.94 
 
 
720 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  34.39 
 
 
542 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.02 
 
 
762 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  30.02 
 
 
762 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  32.72 
 
 
673 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  33.58 
 
 
717 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  32.28 
 
 
578 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
573 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  32.97 
 
 
604 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
685 aa  193  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  37.22 
 
 
536 aa  184  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  31.18 
 
 
634 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  36.86 
 
 
322 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  38.61 
 
 
525 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  26.71 
 
 
594 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  29.27 
 
 
532 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  34.79 
 
 
670 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  31.37 
 
 
488 aa  167  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  28.54 
 
 
637 aa  164  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  28.74 
 
 
531 aa  163  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  25.79 
 
 
514 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  29.84 
 
 
546 aa  156  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  31.03 
 
 
527 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  32.97 
 
 
549 aa  156  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  25 
 
 
529 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  26.36 
 
 
484 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
494 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  28.31 
 
 
519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  30.99 
 
 
524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  25.34 
 
 
548 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  29.17 
 
 
533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  33.21 
 
 
899 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  26.48 
 
 
482 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  29.17 
 
 
636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  33.85 
 
 
889 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
713 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  30.16 
 
 
624 aa  130  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  22.08 
 
 
614 aa  120  9e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  28.67 
 
 
625 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  30.97 
 
 
742 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
538 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
510 aa  101  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  29.47 
 
 
307 aa  100  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  29.51 
 
 
471 aa  88.2  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.51 
 
 
810 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 
878 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.46 
 
 
632 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  31.73 
 
 
626 aa  77.4  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.09 
 
 
816 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.7 
 
 
865 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.67 
 
 
795 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.21 
 
 
725 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
1037 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  31.49 
 
 
780 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
612 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.92 
 
 
887 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  31.66 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
3145 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
709 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 
565 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
909 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  23.58 
 
 
442 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
750 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
583 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
789 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
781 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
708 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
739 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
681 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.99 
 
 
340 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.78 
 
 
689 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
637 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
808 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 
1737 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
780 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  26.7 
 
 
734 aa  60.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
566 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  27.47 
 
 
359 aa  60.5  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
824 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 
638 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2061  sulfotransferase domain-containing protein  29.19 
 
 
291 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.07 
 
 
875 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
627 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>