60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3635 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  328  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  59.06 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5035  hypothetical protein  54.82 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.349078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  61.94 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1286  hypothetical protein  54.43 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  50.93 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  51.5 
 
 		 168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  48.37 
 
 		 179 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  53.55 
 
 		 197 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  46.05 
 
 		 225 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.69 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.26 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  52.26 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2816  hypothetical protein  50.7 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  46.31 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  48.89 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  47.89 
 
 		 189 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1401  hypothetical protein  55.56 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1930  hypothetical protein  44.52 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2007  hypothetical protein  44.52 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100253  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0966  hypothetical protein  43.87 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4106  hypothetical protein  52.63 
 
 		 185 aa  123  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4226  hypothetical protein  42.31 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  42.11 
 
 		 173 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3423  hypothetical protein  44.87 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  41.18 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  43.51 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  48.06 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2376  hypothetical protein  49.28 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  41.67 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155161 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  39.19 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.28 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3057  hypothetical protein  41.98 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3130  hypothetical protein  45.93 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  45.71 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  45.71 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  38.31 
 
 		 192 aa  90.9  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  39.1 
 
 		 503 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  34.86 
 
 		 288 aa  85.1  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  43.18 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  37.58 
 
 		 503 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  30.53 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  32.42 
 
 		 248 aa  70.9  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  35.71 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  34.11 
 
 		 358 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  34 
 
 		 218 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.39 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.79 
 
 		 314 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  30.57 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  32.9 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  32.9 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  32.26 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  28.99 
 
 		 530 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  29.58 
 
 		 248 aa  52.4  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  30.91 
 
 		 253 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  31.13 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1222  S-layer domain protein  30.77 
 
 		 108 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>