More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3634 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  60.56 
 
 		 219 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  59.72 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  60.09 
 
 		 232 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  59.36 
 
 		 219 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  59.62 
 
 		 228 aa  261  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  57.34 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  58.33 
 
 		 221 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  57.08 
 
 		 230 aa  255  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  57.41 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  57.08 
 
 		 219 aa  254  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  57.99 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  59.22 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  56.02 
 
 		 225 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  60.09 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  57.8 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  60.85 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  61.93 
 
 		 227 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  57.59 
 
 		 250 aa  248  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  56.16 
 
 		 219 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  59.81 
 
 		 218 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  57.8 
 
 		 247 aa  244  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  56.88 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  57.34 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  55.96 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  61.11 
 
 		 217 aa  241  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  57.77 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  57.28 
 
 		 220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  55.66 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  54.19 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  56.81 
 
 		 217 aa  228  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  46.76 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  56.99 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  57.07 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  58.85 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  58.85 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  57.73 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  56.77 
 
 		 214 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  54.17 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  43.78 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  51.83 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  52.38 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  53.95 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  39.66 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  40.17 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.74 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  43.42 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.23 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.29 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  44.44 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  45.88 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  45.88 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  40.52 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  45.13 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  43.56 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  36.44 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  44.59 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  41.4 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  42.13 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  37.39 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  41.53 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  44.05 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  44.85 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  43.61 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  35.81 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  41.85 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.79 
 
 		 237 aa  141  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  42.5 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  37.78 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  39.47 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  40.25 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  44.93 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  38.96 
 
 		 230 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.1 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  39.38 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  41.59 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  42.42 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  43.35 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  41.33 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  39.57 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  39.92 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.43 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  39.39 
 
 		 246 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  43.72 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  38.07 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  38.6 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  32.89 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  40.17 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  37.83 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  43.4 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  42.51 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  39.73 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  39.47 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  45.49 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>