30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3630 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
187 aa  376  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  33.85 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  35.76 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  33.14 
 
 
162 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  31.98 
 
 
162 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  32.68 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  31.84 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  31.84 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  31.52 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1096  hypothetical protein  35.14 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  32.35 
 
 
181 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  33.13 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  33.52 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3019  hypothetical protein  31.32 
 
 
182 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  31.46 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  32.37 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  31.4 
 
 
161 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  31.55 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  26.97 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  31.55 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3216  hypothetical protein  29.14 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  30.49 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0410  putative lipoprotein  28.74 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.936059  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0056  hypothetical protein  31.19 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  29.09 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  28.48 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  30.94 
 
 
179 aa  42  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1279  hypothetical protein  25.77 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3925  hypothetical protein  25.56 
 
 
173 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.297382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>