More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3606 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  543  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  57.25 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  60.71 
 
 		 256 aa  315  6e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  61.09 
 
 		 260 aa  291  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  54.86 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.25 
 
 		 265 aa  281  7.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  54.69 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  55.82 
 
 		 268 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  55.6 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  55.6 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  55.6 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  55.6 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  55.2 
 
 		 268 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  55.2 
 
 		 289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  54.88 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  54.33 
 
 		 265 aa  258  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  53.01 
 
 		 256 aa  250  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  52.5 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.08 
 
 		 241 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.67 
 
 		 241 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  48.33 
 
 		 274 aa  245  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  54.2 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  51.25 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  50.42 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  51.68 
 
 		 240 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  51.26 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  51.26 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  51.26 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  51.26 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  51.26 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  51.26 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  51.26 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  50.42 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  50.42 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  49.58 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  50 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.42 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.26 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  49.58 
 
 		 240 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.96 
 
 		 238 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  45.53 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  49.79 
 
 		 236 aa  225  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  45.11 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  45.53 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  45.53 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  45.53 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  45.53 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  45.53 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  45.11 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  45.53 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  42.8 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  48.75 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  45.11 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  42.37 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  45.53 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  41.95 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  41.95 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  42.19 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.11 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  44.49 
 
 		 245 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.07 
 
 		 239 aa  211  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.44 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  46.84 
 
 		 234 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  43.62 
 
 		 243 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.91 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  42.32 
 
 		 242 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40 
 
 		 240 aa  198  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1749  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.07 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0856492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2677  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.8 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.82 
 
 		 245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  43.22 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.4 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0338  hypothetical protein  42.8 
 
 		 239 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  44.26 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0321  hypothetical protein  42.8 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2645  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.8 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0359  hypothetical protein  42.8 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0359  cysteine-rich domain protein  42.8 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.477523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0259  cysteine-rich domain protein  42.8 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00262  predicted oxidoreductase  42.8 
 
 		 239 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3299  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.8 
 
 		 239 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00266  hypothetical protein  42.8 
 
 		 239 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.73 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.03 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2615  hypothetical protein  40.4 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  41.98 
 
 		 250 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2838  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40 
 
 		 247 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0236915  normal  0.339029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3316  hypothetical protein  42.37 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.21 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2930  hypothetical protein  40.8 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.656633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  44.95 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  40.34 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0709  hypothetical protein  39.5 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.162619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4922  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.82 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3622  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.19 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2803  hypothetical protein  41.9 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0695  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.28 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  43.04 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>