More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3543 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 478 aa  937    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 445 aa  289  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  46.13 
 
 		 433 aa  279  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  47.38 
 
 		 438 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 423 aa  275  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  46.13 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  45.63 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 459 aa  266  8e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2689  histidine kinase  48.16 
 
 		 430 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2916  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.15 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.301233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  46.86 
 
 		 346 aa  263  6.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0478  histidine kinase  44.09 
 
 		 438 aa  262  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 350 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.82 
 
 		 346 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  44.23 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  45.71 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  44.51 
 
 		 419 aa  253  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4551  histidine kinase  43.93 
 
 		 480 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  43.27 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  46.88 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  43.18 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  43.27 
 
 		 407 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.56 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  44.09 
 
 		 450 aa  249  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  44.22 
 
 		 443 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  44.77 
 
 		 346 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  47.1 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  41.18 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  41.18 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  41.72 
 
 		 424 aa  236  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  41.83 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 458 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  43.23 
 
 		 587 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  43.23 
 
 		 587 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  42.9 
 
 		 587 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  43.29 
 
 		 587 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  43.29 
 
 		 587 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  43.29 
 
 		 587 aa  220  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  43.29 
 
 		 587 aa  220  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  43.29 
 
 		 587 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  43.29 
 
 		 587 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3575  histidine kinase  40.33 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455968  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.29 
 
 		 587 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 585 aa  217  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 582 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 585 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  43.52 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 608 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 599 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 412 aa  203  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 449 aa  203  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 412 aa  203  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 402 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 607 aa  200  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  39.28 
 
 		 591 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 584 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  36.89 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 594 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 604 aa  196  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  30.75 
 
 		 565 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 597 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 596 aa  194  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  35.48 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 584 aa  193  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  43.5 
 
 		 352 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0542  histidine kinase  33.11 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 600 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  34.06 
 
 		 446 aa  190  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2267  histidine kinase  32.89 
 
 		 472 aa  189  9e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 581 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1492  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 589 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  37.39 
 
 		 555 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.434659  normal  0.0783763 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 590 aa  186  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  32.33 
 
 		 431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  32.33 
 
 		 431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  35.36 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  33.8 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  33.05 
 
 		 598 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  31.9 
 
 		 431 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  31.9 
 
 		 431 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 587 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>