More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3541 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  50.34 
 
 
873 aa  712    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  45.18 
 
 
871 aa  667    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  51.63 
 
 
914 aa  887    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  46.99 
 
 
820 aa  756    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  57.9 
 
 
876 aa  882    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  53.24 
 
 
919 aa  835    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  47.03 
 
 
882 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  56.63 
 
 
910 aa  934    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  57.03 
 
 
883 aa  931    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  56.22 
 
 
896 aa  851    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  57.64 
 
 
880 aa  936    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  56.05 
 
 
916 aa  853    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  56.9 
 
 
877 aa  879    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  46.13 
 
 
804 aa  761    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  54.52 
 
 
962 aa  819    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  57.65 
 
 
880 aa  895    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  57.38 
 
 
888 aa  930    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  57.53 
 
 
910 aa  962    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  57.56 
 
 
875 aa  896    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  53.79 
 
 
925 aa  781    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.92 
 
 
872 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  56.28 
 
 
929 aa  806    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  57.54 
 
 
907 aa  947    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
929 aa  1828    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  56.5 
 
 
905 aa  800    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  55.73 
 
 
910 aa  935    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  57.88 
 
 
911 aa  944    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  52.52 
 
 
858 aa  788    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  43.54 
 
 
815 aa  659    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  45.11 
 
 
804 aa  744    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  58.23 
 
 
877 aa  918    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  57.93 
 
 
915 aa  907    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  57.21 
 
 
882 aa  941    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  57.62 
 
 
908 aa  936    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  57.73 
 
 
923 aa  945    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  57.96 
 
 
907 aa  951    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  56.23 
 
 
921 aa  885    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  59.17 
 
 
879 aa  944    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  52.97 
 
 
864 aa  773    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  55.82 
 
 
916 aa  843    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  57.89 
 
 
881 aa  937    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  61.28 
 
 
908 aa  973    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  56.63 
 
 
898 aa  934    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  54.56 
 
 
904 aa  833    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  43.75 
 
 
891 aa  654    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  54.28 
 
 
897 aa  830    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  57.29 
 
 
878 aa  895    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  54.99 
 
 
904 aa  804    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  44.79 
 
 
868 aa  669    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 
870 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.55 
 
 
872 aa  626  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 
863 aa  624  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 
869 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  41.44 
 
 
863 aa  623  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 
872 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 
855 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 
855 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 
855 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 
855 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 
855 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  45.82 
 
 
862 aa  618  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 
904 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 
881 aa  616  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 
855 aa  618  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 
851 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 
869 aa  615  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 
855 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 
870 aa  615  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 
858 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 
852 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 
854 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 
854 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  41.62 
 
 
853 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 
855 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  42.55 
 
 
881 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 
873 aa  611  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 
854 aa  610  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  38.32 
 
 
870 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 
851 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 
851 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 
855 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  41.73 
 
 
853 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  41.39 
 
 
896 aa  609  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 
853 aa  611  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 
859 aa  611  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  43.34 
 
 
872 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  43.52 
 
 
878 aa  611  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  44.12 
 
 
854 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  45.41 
 
 
823 aa  606  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 
862 aa  608  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 
851 aa  608  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 
871 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.49 
 
 
862 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.83 
 
 
859 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 
859 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.53 
 
 
856 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 
860 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 
932 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 
857 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 
889 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>