More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3538 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  100 
 
 		 513 aa  1008    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  49.71 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  47 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  49.67 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  45.53 
 
 		 513 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  45.53 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  45.33 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  44.51 
 
 		 522 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  44.69 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  46.9 
 
 		 529 aa  360  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  46.15 
 
 		 523 aa  358  9e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  47.08 
 
 		 528 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  43.45 
 
 		 529 aa  350  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  44.9 
 
 		 555 aa  348  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  41.67 
 
 		 520 aa  347  4e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  42.58 
 
 		 514 aa  343  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  43.16 
 
 		 528 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  43.16 
 
 		 526 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  42.53 
 
 		 543 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  45.86 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  43.54 
 
 		 509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  44.66 
 
 		 534 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  42.94 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  45.91 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  42.23 
 
 		 508 aa  336  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  45.9 
 
 		 525 aa  335  9e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  40.8 
 
 		 511 aa  335  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  41.82 
 
 		 530 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  49.76 
 
 		 510 aa  333  6e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  43.49 
 
 		 535 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  44.14 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  42.16 
 
 		 521 aa  331  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  39.8 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  41.06 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  39.14 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  38.55 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  43.84 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  38.33 
 
 		 524 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  38.33 
 
 		 524 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  38.33 
 
 		 524 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  38.34 
 
 		 511 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  38.33 
 
 		 524 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  38.33 
 
 		 524 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  42.92 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  41.08 
 
 		 522 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  40.24 
 
 		 518 aa  326  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  42.46 
 
 		 509 aa  324  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  38.16 
 
 		 542 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  40.04 
 
 		 522 aa  323  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  43.55 
 
 		 517 aa  323  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  43.55 
 
 		 517 aa  323  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  43.95 
 
 		 508 aa  322  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  43.46 
 
 		 534 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  38.16 
 
 		 511 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  44.22 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.342174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  38.67 
 
 		 511 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  38.67 
 
 		 511 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  38.67 
 
 		 511 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  38.67 
 
 		 511 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  38.48 
 
 		 511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  38.48 
 
 		 511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  38.48 
 
 		 511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  38.48 
 
 		 511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  38.48 
 
 		 511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  38.54 
 
 		 511 aa  320  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  37.48 
 
 		 512 aa  316  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  40.28 
 
 		 495 aa  316  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  39.96 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  35.87 
 
 		 495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  41.15 
 
 		 511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  42.96 
 
 		 512 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  44.16 
 
 		 512 aa  313  5.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  39.82 
 
 		 498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  38.52 
 
 		 508 aa  310  4e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  40.62 
 
 		 528 aa  310  5e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  38.03 
 
 		 516 aa  309  6.999999999999999e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  37.79 
 
 		 513 aa  309  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  36.61 
 
 		 505 aa  309  9e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  35.08 
 
 		 531 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  40.52 
 
 		 512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  37.83 
 
 		 516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  36.78 
 
 		 516 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  37.35 
 
 		 512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  38.1 
 
 		 512 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  38.1 
 
 		 512 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  37.16 
 
 		 528 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  41.75 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  39.49 
 
 		 512 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  35.98 
 
 		 525 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  40.17 
 
 		 512 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  45.83 
 
 		 509 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  42.43 
 
 		 519 aa  299  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  39.72 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  39.31 
 
 		 523 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  35.74 
 
 		 519 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  38.94 
 
 		 523 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  40.5 
 
 		 522 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  37.41 
 
 		 534 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  35.54 
 
 		 519 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  38.21 
 
 		 513 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>