34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3532 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  367  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  52.32 
 
 
173 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  47.06 
 
 
163 aa  133  2e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  46.05 
 
 
162 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  50.32 
 
 
168 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  45.33 
 
 
162 aa  116  2e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  41.45 
 
 
163 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  1.51739e-05 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  46.71 
 
 
179 aa  113  2e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  42.57 
 
 
151 aa  112  2e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  42.57 
 
 
151 aa  113  2e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  42.11 
 
 
158 aa  113  2e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  42.38 
 
 
151 aa  110  1e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
168 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  42.57 
 
 
151 aa  101  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  39.87 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 
151 aa  98.2  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  37.66 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  40.4 
 
 
151 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  40.15 
 
 
134 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  37.66 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  39.61 
 
 
164 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  39.87 
 
 
163 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  39.22 
 
 
163 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  39.22 
 
 
167 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  37.66 
 
 
164 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  40.8 
 
 
164 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  35.06 
 
 
164 aa  80.5  1e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 
167 aa  80.9  1e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  35.76 
 
 
152 aa  79.3  3e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
151 aa  68.9  4e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  37.91 
 
 
151 aa  50.4  1e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  32.68 
 
 
390 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  32.5 
 
 
271 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>