297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3531 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  60.54 
 
 		 187 aa  234  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  60.87 
 
 		 189 aa  234  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  59.26 
 
 		 188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  60.54 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  59.89 
 
 		 186 aa  231  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  62.3 
 
 		 184 aa  231  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  57.59 
 
 		 190 aa  230  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  61.96 
 
 		 186 aa  230  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  61.29 
 
 		 187 aa  230  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  60.96 
 
 		 186 aa  228  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  59.26 
 
 		 189 aa  228  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  58.12 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  58.12 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  59.68 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  59.14 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  58.51 
 
 		 201 aa  221  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  57.07 
 
 		 192 aa  221  6e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  61.96 
 
 		 186 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  55.03 
 
 		 188 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  56.91 
 
 		 187 aa  218  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  59.36 
 
 		 187 aa  218  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  56.38 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  56.38 
 
 		 188 aa  215  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  56.38 
 
 		 188 aa  215  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  57.3 
 
 		 188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  60.33 
 
 		 186 aa  214  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  57.87 
 
 		 188 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  57.67 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  57.54 
 
 		 188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  54.5 
 
 		 189 aa  210  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  53.72 
 
 		 192 aa  209  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  53.68 
 
 		 190 aa  207  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  56.76 
 
 		 191 aa  207  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  53.33 
 
 		 190 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  57.84 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  52.66 
 
 		 187 aa  204  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  53.55 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  57.84 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  56.38 
 
 		 188 aa  197  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  49.74 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  47.8 
 
 		 180 aa  187  8e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  53.19 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  46.83 
 
 		 326 aa  180  8.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  51.32 
 
 		 309 aa  179  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  45.99 
 
 		 191 aa  178  2.9999999999999997e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  45.79 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  44.74 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.86 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  45.21 
 
 		 254 aa  165  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  44.74 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.07 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  44.04 
 
 		 242 aa  148  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  41.99 
 
 		 191 aa  148  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.64 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  37.89 
 
 		 299 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.42 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  34.69 
 
 		 305 aa  114  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.11 
 
 		 299 aa  99.4  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  31.49 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  26.37 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  27.07 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.22 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.77 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.82 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  50 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  44.3 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  48.39 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  44.3 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  39.47 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  43.04 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  45.33 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  48.39 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  40.7 
 
 		 103 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.77 
 
 		 76 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.39 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.39 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  47.46 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  46.55 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.33 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  45.16 
 
 		 76 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  43.24 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  45.31 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  45.33 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  41.56 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  41.56 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  41.56 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  41.56 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  41.56 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  41.56 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  45.9 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  41.56 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  41.56 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  46.67 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>