More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3477 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  764  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  62.88 
 
 
395 aa  441  1e-122  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  67.21 
 
 
415 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  67.39 
 
 
415 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  63.24 
 
 
397 aa  417  1e-115  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  61.73 
 
 
389 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  60.05 
 
 
389 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  58.18 
 
 
396 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  57.85 
 
 
403 aa  361  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  59.63 
 
 
396 aa  347  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  62.22 
 
 
408 aa  346  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  48.4 
 
 
404 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  50.67 
 
 
399 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  51.21 
 
 
400 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  51.25 
 
 
399 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  51.51 
 
 
398 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  51.51 
 
 
429 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  51.51 
 
 
398 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  51.51 
 
 
398 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  51.51 
 
 
398 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  51.51 
 
 
398 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  51.51 
 
 
429 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  45.81 
 
 
383 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  43.13 
 
 
394 aa  268  9e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  47.8 
 
 
391 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  1.66249e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  48.64 
 
 
394 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  50.4 
 
 
399 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  48.86 
 
 
394 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  48.86 
 
 
394 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  48.2 
 
 
403 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  50.53 
 
 
399 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  51.25 
 
 
399 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  50.97 
 
 
399 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  50.69 
 
 
399 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  50.69 
 
 
399 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  52.14 
 
 
398 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 
406 aa  246  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  48.99 
 
 
407 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 
403 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  41.6 
 
 
393 aa  240  3e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  41.76 
 
 
390 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  44.74 
 
 
419 aa  239  6e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  40.91 
 
 
403 aa  236  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  47.03 
 
 
403 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  48.45 
 
 
402 aa  233  4e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 
406 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  40.35 
 
 
407 aa  232  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 
406 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 
406 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.95 
 
 
405 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.95 
 
 
405 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  46.72 
 
 
410 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.95 
 
 
405 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  39.54 
 
 
407 aa  230  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  40.4 
 
 
405 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  40.77 
 
 
404 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  40.4 
 
 
405 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  46.58 
 
 
403 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 
402 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  46.13 
 
 
412 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  47.66 
 
 
405 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  41.11 
 
 
405 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40.59 
 
 
400 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40.59 
 
 
400 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  45.86 
 
 
412 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  45.86 
 
 
412 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  46.76 
 
 
402 aa  226  5e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40.59 
 
 
400 aa  226  5e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  42.42 
 
 
401 aa  225  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  46.76 
 
 
402 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.86 
 
 
399 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  40.41 
 
 
404 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  40.05 
 
 
399 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  41.38 
 
 
395 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 
410 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  39.79 
 
 
399 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  41.78 
 
 
398 aa  223  5e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  39.79 
 
 
399 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  39.75 
 
 
399 aa  220  4e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  39.75 
 
 
399 aa  220  4e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  39.75 
 
 
399 aa  220  4e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05543  hypothetical protein  42.86 
 
 
399 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331898  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  41.62 
 
 
394 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 
389 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  41.55 
 
 
398 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  38.27 
 
 
415 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  39.89 
 
 
385 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 
447 aa  215  1e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  40.36 
 
 
394 aa  214  2e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  40.36 
 
 
394 aa  214  2e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  40.36 
 
 
394 aa  214  2e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  37.81 
 
 
389 aa  214  2e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  40.36 
 
 
394 aa  214  2e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  37.81 
 
 
389 aa  214  2e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 
387 aa  214  2e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  48.71 
 
 
410 aa  213  6e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  48.71 
 
 
410 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 
399 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  40.1 
 
 
394 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  50.93 
 
 
420 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>