More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3464 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3464  transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  364  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2378  transcriptional regulator  63.22 
 
 		 174 aa  248  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4792  putative PAS/PAC sensor protein  51.15 
 
 		 174 aa  193  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4683  putative PAS/PAC sensor protein  50.3 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4977  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4662  putative PAS/PAC sensor protein  48.81 
 
 		 168 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.193201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1312  putative PAS/PAC sensor protein  48.28 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  0.171791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3403  PAS sensor protein  48.52 
 
 		 189 aa  183  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.98 
 
 		 174 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1413  putative PAS/PAC sensor protein  46.51 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.026067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4975  putative PAS/PAC sensor protein  49.41 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161434  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1071  putative PAS/PAC sensor protein  49.41 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4009  PAS  45.93 
 
 		 172 aa  167  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0920  putative PAS/PAC sensor protein  46.29 
 
 		 170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0368  PAS sensor protein  50 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05500  PAS domain S-box  40.59 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2233  putative PAS/PAC sensor protein  42.07 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0964  putative PAS domain signal transduction sensor protein  42.33 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.695373  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1233  methyl-accepting chemotaxis protein  41.72 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0158  PAS sensor protein  39.08 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00559927  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1323  methyl-accepting chemotaxis protein  41.72 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1204  methyl-accepting chemotaxis protein  41.72 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0044  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1325  methyl-accepting chemotaxis protein  40.49 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0735034  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1206  methyl-accepting chemotaxis protein  40.49 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1962  methyl-accepting chemotaxis protein  39.88 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0540  methyl-accepting chemotaxis protein  41.46 
 
 		 166 aa  134  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0963  putative PAS domain signal transduction sensor protein  38.65 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.598174  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1012  methyl-accepting chemotaxis protein  37.2 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63093  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1223  signal-transduction sensor protein  40.94 
 
 		 189 aa  124  5e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.658782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2936  putative PAS/PAC sensor protein  37.29 
 
 		 201 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178135  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0659  putative PAS/PAC sensor protein  46.67 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1291  PAS sensor protein  38.93 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0995  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.41 
 
 		 517 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0064  PAS sensor protein  38.73 
 
 		 456 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0130  PAS sensor protein  37.08 
 
 		 451 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 		 521 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.258308  normal  0.504821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.94 
 
 		 566 aa  114  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2987  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.74 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1522  PAS sensor protein  34.29 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.533099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3519  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.04 
 
 		 514 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2920  aerotaxis sensor receptor  40.26 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0729  PAS  42.75 
 
 		 945 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0635035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.16 
 
 		 522 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44300  aerotaxis receptor Aer  38.71 
 
 		 521 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  39.52 
 
 		 521 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1385  methyl-accepting chemotaxis protein  41.94 
 
 		 520 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2525  putative PAS/PAC sensor protein  40.48 
 
 		 208 aa  111  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0659487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.13 
 
 		 522 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.13 
 
 		 522 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0725  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 		 495 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.16 
 
 		 419 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3406  PAS  40.32 
 
 		 521 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387271  normal  0.671486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.68 
 
 		 521 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.378373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 		 521 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3595  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 		 515 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.58 
 
 		 521 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.28 
 
 		 533 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.09 
 
 		 522 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.46 
 
 		 522 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.160306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 		 522 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.28 
 
 		 522 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  42.75 
 
 		 565 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1521  putative PAS/PAC sensor protein  34.88 
 
 		 228 aa  108  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.950455  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0532  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.8 
 
 		 523 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0374128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2014  aerotaxis receptor  39.37 
 
 		 521 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2812  putative PAS/PAC sensor protein  38.13 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.494423  decreased coverage  0.000000324615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.94 
 
 		 521 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664053  normal  0.0821551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  43.64 
 
 		 1214 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.94 
 
 		 521 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.629648  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.01 
 
 		 521 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 		 534 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2257  aerotaxis receptor Aer-1  36.96 
 
 		 521 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215452  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3735  PAS  40.16 
 
 		 521 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1833  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  37.8 
 
 		 521 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.884809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0553  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  50.47 
 
 		 888 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  49.02 
 
 		 1170 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.17 
 
 		 532 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.28 
 
 		 520 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  37.01 
 
 		 521 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4521  aerotaxis receptor, putative  41.94 
 
 		 521 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.86 
 
 		 520 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6942  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.22 
 
 		 566 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  35.76 
 
 		 714 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1378  putative PAS/PAC sensor protein  33.52 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 		 521 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1648  aerotaxis receptor  38.58 
 
 		 521 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4658  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  42.37 
 
 		 529 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.35 
 
 		 853 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.41 
 
 		 550 aa  104  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1652  putative PAS/PAC sensor protein  39.52 
 
 		 127 aa  104  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.129926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1618  chemotaxis sensory transducer  40.32 
 
 		 557 aa  104  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126465 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0618  methyl-accepting chemotaxis protein  37.98 
 
 		 583 aa  104  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2292  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.22 
 
 		 517 aa  104  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2452  PAS  44.07 
 
 		 518 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.37 
 
 		 598 aa  104  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2390  methyl-accepting chemotaxis protein  37.98 
 
 		 580 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.790589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0264  methyl-accepting chemotaxis protein  37.98 
 
 		 580 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0760  aerotaxis sensor receptor  37.98 
 
 		 583 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>