More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3443 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 801 aa  1586    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 861 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 830 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 830 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 843 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 857 aa  392  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  36.35 
 
 		 826 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 829 aa  392  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 859 aa  385  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0207  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 837 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0821  histidine kinase  36.98 
 
 		 858 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2099  sensory box histidine kinase, putative  36.97 
 
 		 859 aa  382  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3963  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 861 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  36.81 
 
 		 838 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2016  putative sensory box histidine kinase  36.83 
 
 		 837 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 842 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  37.11 
 
 		 846 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 862 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4290  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 861 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731111  normal  0.889005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 837 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0050  two component sensor kinase  33.82 
 
 		 911 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0588  histidine kinase  35.71 
 
 		 903 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3296  histidine kinase  41.38 
 
 		 837 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.584314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  37.64 
 
 		 835 aa  365  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3577  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 843 aa  360  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0624  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 837 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0348163  normal  0.542065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 838 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 798 aa  356  7.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 770 aa  348  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1354  sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 824 aa  333  7.000000000000001e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 782 aa  320  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0262543  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 787 aa  307  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.842242  normal  0.67921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  40.16 
 
 		 508 aa  167  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 1046 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  38.14 
 
 		 503 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 778 aa  159  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 957 aa  157  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 573 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 		 1369 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 513 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 856 aa  153  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4234  histidine kinase  33.45 
 
 		 828 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4296  CBS sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 851 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.277428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 646 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  33.68 
 
 		 729 aa  151  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 763 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 763 aa  151  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 1977 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 844 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  32.62 
 
 		 576 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 763 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1352 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 546 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  39.3 
 
 		 525 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 754 aa  149  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 661 aa  148  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  33.77 
 
 		 548 aa  148  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 1237 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1603 aa  147  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 1070 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  33.33 
 
 		 565 aa  146  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 733 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 853 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  33.89 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 1643 aa  145  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 		 877 aa  145  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  40.32 
 
 		 464 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1069 aa  144  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 		 1127 aa  144  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 907 aa  144  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 858 aa  144  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 1177 aa  144  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 579 aa  144  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 676 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 577 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 765 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  34.98 
 
 		 599 aa  143  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 798 aa  143  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  32.78 
 
 		 957 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 970 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1068 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 		 1202 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 523 aa  142  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 575 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 792 aa  142  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 940 aa  142  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 502 aa  142  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 371 aa  142  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 764 aa  142  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 587 aa  142  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 		 1287 aa  142  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 763 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5073  CBS sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1118 aa  142  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.749087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.73 
 
 		 923 aa  141  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 757 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>