More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3436 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  57.71 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  55.7 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  55.84 
 
 		 250 aa  245  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  53.48 
 
 		 240 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  53.72 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  52.14 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  55.79 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  52.61 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  54.63 
 
 		 248 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  52.74 
 
 		 248 aa  238  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  52.17 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  53.51 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  50.87 
 
 		 240 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  52.47 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  50.61 
 
 		 252 aa  231  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  51.52 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  51.09 
 
 		 236 aa  229  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  47.86 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  50.85 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  53.04 
 
 		 240 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  48.71 
 
 		 239 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  46.35 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  48.25 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  48.09 
 
 		 239 aa  205  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  46.58 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  47.84 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  42.49 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  47.83 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  45.7 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  42.49 
 
 		 243 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  45.33 
 
 		 237 aa  178  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  45.96 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  43.16 
 
 		 221 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  41.85 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  43.16 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  41.53 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  39.06 
 
 		 226 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  39.83 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  37.23 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  39.57 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  36.67 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  38.43 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.19 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  36.84 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  33.19 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  40.62 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  39.91 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  38.82 
 
 		 224 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  37.66 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  34.91 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  37.44 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  37 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  37 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  37.45 
 
 		 223 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  38.5 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  38.05 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  38.33 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  36.93 
 
 		 225 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  38.05 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  36.6 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  39.01 
 
 		 221 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  38.05 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  36.1 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  37.66 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  34.78 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  37.97 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  35.97 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  36.48 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  35.78 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  35.34 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  37.13 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  37 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  35.89 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  39.65 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  35.34 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  30.67 
 
 		 220 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  38.1 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  35.84 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  36.36 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  37.77 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4828  nucleotidyl transferase  35.74 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  30.67 
 
 		 220 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  32 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  33.47 
 
 		 230 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  36.8 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  36.4 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  36.13 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  35.45 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  35.93 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  34.16 
 
 		 240 aa  99  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 251 aa  98.6  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  37.83 
 
 		 234 aa  98.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4583  nucleotidyl transferase  35.25 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.693762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>