More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3431 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  100 
 
 		 435 aa  843    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  54.17 
 
 		 421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  56.35 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  53.32 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  51.94 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  55.89 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  53.47 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  52.42 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  53.11 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  51.49 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  54.82 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  52.57 
 
 		 441 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  53.91 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  52.35 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  50.78 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  54.36 
 
 		 437 aa  364  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  50.79 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  51.6 
 
 		 448 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  52.57 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  51.8 
 
 		 447 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  53.35 
 
 		 441 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  50.56 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  54.69 
 
 		 422 aa  355  7.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  49.43 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  49.32 
 
 		 448 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  47.3 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  47.07 
 
 		 442 aa  348  7e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  48.75 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  46.62 
 
 		 442 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  50.23 
 
 		 447 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  50.12 
 
 		 432 aa  339  7e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  46.85 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  48.97 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  47.96 
 
 		 447 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  46.09 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  45.88 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  41.15 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  44.44 
 
 		 440 aa  315  8e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  42.23 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  48.62 
 
 		 437 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  41.96 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  45.05 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  46.29 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  46.3 
 
 		 435 aa  282  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  44.77 
 
 		 397 aa  275  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  41.31 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  41.47 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.37 
 
 		 427 aa  236  7e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  38.18 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  39.72 
 
 		 427 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  40 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  45.76 
 
 		 422 aa  232  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  38.77 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  36.24 
 
 		 443 aa  226  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  37.44 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  37.44 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.71 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  36.81 
 
 		 432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.34 
 
 		 431 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  34.74 
 
 		 431 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  36.24 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  36 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  39 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  35.93 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  35.93 
 
 		 423 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  35.17 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  34.93 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  34.21 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  38.51 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  37.87 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  38.44 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  34.21 
 
 		 432 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.7 
 
 		 424 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  35.41 
 
 		 423 aa  213  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  34.21 
 
 		 432 aa  213  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 		 425 aa  212  7.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  36.98 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  37.84 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  44.17 
 
 		 386 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  38.7 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  39.09 
 
 		 459 aa  209  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.61 
 
 		 466 aa  209  8e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  37.54 
 
 		 421 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.75 
 
 		 422 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  38.31 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  34.55 
 
 		 438 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  38.31 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3762  FolC bifunctional protein  39.6 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  38.62 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.62 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  37.15 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  38.19 
 
 		 421 aa  202  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.87 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.38 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  43.72 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  36.21 
 
 		 437 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  37.92 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.35 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  39.06 
 
 		 442 aa  200  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.35 
 
 		 422 aa  200  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>