More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3376 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 432 aa  866    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  50.13 
 
 		 382 aa  325  9e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  46.74 
 
 		 434 aa  298  9e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  48.01 
 
 		 388 aa  296  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  47.78 
 
 		 409 aa  296  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  48.04 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  48.04 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2194  glycosyl transferase, group 1  52.15 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0354582  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  46.86 
 
 		 428 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  47 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  46.13 
 
 		 379 aa  269  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  45.38 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  42.48 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2130  glycosyl transferase group 1  38.26 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2108  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 		 444 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000441708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 		 371 aa  199  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  29.68 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0640  glycosyl transferase group 1  34.79 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0082  hypothetical protein  37.5 
 
 		 376 aa  179  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1868  putative glycosyltransferase  36.46 
 
 		 376 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0068  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02625  glycosyltransferase  36.9 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0467  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 		 344 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0442  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  42.72 
 
 		 468 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  40.83 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 821 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  30.92 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  34.01 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 828 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 		 821 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 		 822 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  43.98 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 819 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 377 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.13 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 370 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.57 
 
 		 413 aa  96.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 373 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 		 378 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 385 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 		 335 aa  93.6  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 405 aa  92.8  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1789  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  34 
 
 		 818 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 390 aa  91.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 366 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  33.47 
 
 		 820 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.58 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 421 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0824  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 		 432 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.498308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.58 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.58 
 
 		 498 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0811  glycosyl transferase  24.68 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.115304  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.94 
 
 		 443 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 		 482 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 402 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.26 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.26 
 
 		 499 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.26 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.26 
 
 		 495 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 381 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 375 aa  87  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>