More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3342 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  57.39 
 
 		 292 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 		 293 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 		 295 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 290 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 		 290 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 		 290 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 290 aa  285  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 290 aa  279  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  50.91 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  48.73 
 
 		 292 aa  271  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 292 aa  266  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 		 290 aa  262  6e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 291 aa  258  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  45.3 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 292 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  43.55 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  41.9 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 293 aa  241  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 		 291 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  43.6 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 292 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  43.39 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 292 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  40.82 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  43.17 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  41.16 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  42.11 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  43.73 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  41.81 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 292 aa  235  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 304 aa  234  9e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 296 aa  234  9e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  43.6 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  42.05 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  42.46 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 298 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  40.68 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 		 292 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  39.44 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  41.85 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 295 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  41.02 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  43.46 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>