199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3310 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3310  ISMca6, transposase, OrfB  100 
 
 		 152 aa  314  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1610  ISMca6, transposase, OrfB  39.13 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0032  ISMca6, transposase, OrfB  36.23 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151257  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5660  transposase ISAs1 family protein  34.09 
 
 		 333 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315532 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  31.06 
 
 		 393 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  38.33 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  45.83 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  45.83 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  45.83 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  34.67 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  31.11 
 
 		 372 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2058  hypothetical protein  43.94 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00443479  normal  0.186203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4211  transposase, IS4  50 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  32.09 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  32.09 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0118  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0150  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0201  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0304  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0856099  hitchhiker  0.00019889 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0308  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00145188  decreased coverage  0.0000198477 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0737  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0945  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1127  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.418857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1209  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000367685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1511  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.673335  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1766  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.398767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2081  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2130  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0125473 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2135  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0139526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2181  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000268633 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2330  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2396  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2426  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.67588  hitchhiker  0.000659756 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2580  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2772  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2789  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2798  transposase, IS4  46.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  32.28 
 
 		 372 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  34.53 
 
 		 483 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  46.03 
 
 		 409 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  46.03 
 
 		 433 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  34.43 
 
 		 373 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3482  transposase, IS4 family protein  44.64 
 
 		 327 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.249116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  34.06 
 
 		 381 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  34.06 
 
 		 381 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  34.06 
 
 		 381 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3009  transposase  32.79 
 
 		 370 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3953  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 388 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 388 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 388 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 388 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 388 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2993  H repeat-containing protein  40.91 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.937922  normal  0.482071 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4877  H repeat-containing protein  40.91 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 388 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 388 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  35.82 
 
 		 415 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  35.82 
 
 		 437 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  31.97 
 
 		 378 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  41.38 
 
 		 395 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  33.05 
 
 		 378 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2070  transposase, IS4  33.83 
 
 		 369 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  30.47 
 
 		 374 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  32.56 
 
 		 404 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  31.97 
 
 		 378 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  30.47 
 
 		 374 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  32.79 
 
 		 378 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  31.97 
 
 		 378 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  27.64 
 
 		 369 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  29.69 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4881  transposase, IS4 family protein  41.07 
 
 		 278 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  27.64 
 
 		 369 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  27.64 
 
 		 369 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  27.64 
 
 		 369 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  27.64 
 
 		 369 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>